Protein–RNA interactions for Protein: P30793

GCH1, GTP cyclohydrolase 1, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCH1P30793 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCH1P30793 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCH1P30793 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GCH1P30793 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GCH1P30793 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GCH1P30793 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GCH1P30793 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GCH1P30793 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GCH1P30793 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GCH1P30793 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GCH1P30793 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GCH1P30793 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GCH1P30793 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GCH1P30793 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GCH1P30793 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GCH1P30793 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GCH1P30793 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GCH1P30793 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GCH1P30793 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GCH1P30793 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GCH1P30793 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GCH1P30793 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GCH1P30793 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GCH1P30793 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCH1P30793 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GCH1P30793 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GCH1P30793 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GCH1P30793 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GCH1P30793 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GCH1P30793 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GCH1P30793 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCH1P30793 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCH1P30793 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCH1P30793 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCH1P30793 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCH1P30793 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCH1P30793 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCH1P30793 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCH1P30793 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCH1P30793 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GCH1P30793 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GCH1P30793 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GCH1P30793 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCH1P30793 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCH1P30793 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCH1P30793 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCH1P30793 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCH1P30793 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCH1P30793 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCH1P30793 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCH1P30793 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCH1P30793 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCH1P30793 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCH1P30793 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCH1P30793 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GCH1P30793 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GCH1P30793 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCH1P30793 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCH1P30793 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCH1P30793 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCH1P30793 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCH1P30793 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCH1P30793 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCH1P30793 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCH1P30793 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCH1P30793 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCH1P30793 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GCH1P30793 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCH1P30793 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCH1P30793 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCH1P30793 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCH1P30793 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCH1P30793 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCH1P30793 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCH1P30793 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCH1P30793 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCH1P30793 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCH1P30793 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GCH1P30793 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCH1P30793 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCH1P30793 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCH1P30793 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCH1P30793 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GCH1P30793 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GCH1P30793 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GCH1P30793 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCH1P30793 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCH1P30793 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCH1P30793 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCH1P30793 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCH1P30793 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCH1P30793 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCH1P30793 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCH1P30793 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCH1P30793 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCH1P30793 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCH1P30793 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCH1P30793 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCH1P30793 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCH1P30793 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms