Protein–RNA interactions for Protein: P25705

ATP5A1, ATP synthase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5A1P25705 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP5A1P25705 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP5A1P25705 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP5A1P25705 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP5A1P25705 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP5A1P25705 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP5A1P25705 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP5A1P25705 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP5A1P25705 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP5A1P25705 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ATP5A1P25705 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP5A1P25705 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP5A1P25705 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP5A1P25705 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP5A1P25705 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP5A1P25705 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP5A1P25705 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP5A1P25705 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP5A1P25705 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP5A1P25705 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP5A1P25705 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP5A1P25705 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP5A1P25705 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP5A1P25705 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP5A1P25705 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP5A1P25705 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP5A1P25705 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP5A1P25705 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP5A1P25705 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP5A1P25705 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP5A1P25705 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP5A1P25705 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP5A1P25705 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP5A1P25705 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP5A1P25705 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP5A1P25705 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP5A1P25705 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP5A1P25705 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP5A1P25705 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP5A1P25705 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP5A1P25705 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP5A1P25705 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP5A1P25705 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP5A1P25705 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP5A1P25705 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP5A1P25705 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP5A1P25705 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP5A1P25705 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP5A1P25705 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP5A1P25705 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP5A1P25705 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP5A1P25705 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP5A1P25705 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP5A1P25705 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP5A1P25705 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP5A1P25705 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP5A1P25705 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP5A1P25705 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP5A1P25705 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ATP5A1P25705 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP5A1P25705 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP5A1P25705 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP5A1P25705 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP5A1P25705 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP5A1P25705 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP5A1P25705 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP5A1P25705 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP5A1P25705 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP5A1P25705 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP5A1P25705 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP5A1P25705 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP5A1P25705 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP5A1P25705 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP5A1P25705 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP5A1P25705 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP5A1P25705 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP5A1P25705 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP5A1P25705 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP5A1P25705 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP5A1P25705 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP5A1P25705 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP5A1P25705 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP5A1P25705 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP5A1P25705 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP5A1P25705 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP5A1P25705 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP5A1P25705 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP5A1P25705 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP5A1P25705 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP5A1P25705 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP5A1P25705 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP5A1P25705 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP5A1P25705 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP5A1P25705 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP5A1P25705 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP5A1P25705 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP5A1P25705 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP5A1P25705 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP5A1P25705 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP5A1P25705 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms