Protein–RNA interactions for Protein: P25025

CXCR2, C-X-C chemokine receptor type 2, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR2P25025 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CXCR2P25025 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CXCR2P25025 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CXCR2P25025 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CXCR2P25025 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CXCR2P25025 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CXCR2P25025 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CXCR2P25025 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CXCR2P25025 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CXCR2P25025 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CXCR2P25025 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CXCR2P25025 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CXCR2P25025 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CXCR2P25025 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CXCR2P25025 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CXCR2P25025 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CXCR2P25025 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CXCR2P25025 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CXCR2P25025 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CXCR2P25025 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CXCR2P25025 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CXCR2P25025 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CXCR2P25025 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CXCR2P25025 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CXCR2P25025 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CXCR2P25025 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CXCR2P25025 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CXCR2P25025 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CXCR2P25025 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CXCR2P25025 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CXCR2P25025 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CXCR2P25025 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CXCR2P25025 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CXCR2P25025 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CXCR2P25025 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CXCR2P25025 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CXCR2P25025 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CXCR2P25025 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CXCR2P25025 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CXCR2P25025 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CXCR2P25025 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CXCR2P25025 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CXCR2P25025 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CXCR2P25025 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CXCR2P25025 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CXCR2P25025 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CXCR2P25025 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CXCR2P25025 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CXCR2P25025 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CXCR2P25025 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CXCR2P25025 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CXCR2P25025 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CXCR2P25025 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CXCR2P25025 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CXCR2P25025 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CXCR2P25025 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CXCR2P25025 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CXCR2P25025 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CXCR2P25025 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CXCR2P25025 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CXCR2P25025 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CXCR2P25025 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CXCR2P25025 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CXCR2P25025 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CXCR2P25025 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CXCR2P25025 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CXCR2P25025 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CXCR2P25025 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CXCR2P25025 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CXCR2P25025 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CXCR2P25025 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CXCR2P25025 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CXCR2P25025 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CXCR2P25025 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CXCR2P25025 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CXCR2P25025 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CXCR2P25025 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CXCR2P25025 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CXCR2P25025 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CXCR2P25025 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CXCR2P25025 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CXCR2P25025 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CXCR2P25025 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CXCR2P25025 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CXCR2P25025 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CXCR2P25025 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CXCR2P25025 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CXCR2P25025 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CXCR2P25025 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CXCR2P25025 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CXCR2P25025 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CXCR2P25025 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CXCR2P25025 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CXCR2P25025 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CXCR2P25025 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CXCR2P25025 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CXCR2P25025 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CXCR2P25025 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CXCR2P25025 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CXCR2P25025 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms