Protein–RNA interactions for Protein: P24522

GADD45A, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45AP24522 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GADD45AP24522 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GADD45AP24522 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GADD45AP24522 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GADD45AP24522 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GADD45AP24522 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GADD45AP24522 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GADD45AP24522 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GADD45AP24522 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GADD45AP24522 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GADD45AP24522 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GADD45AP24522 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GADD45AP24522 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GADD45AP24522 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GADD45AP24522 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GADD45AP24522 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GADD45AP24522 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
GADD45AP24522 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GADD45AP24522 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GADD45AP24522 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GADD45AP24522 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GADD45AP24522 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GADD45AP24522 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GADD45AP24522 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GADD45AP24522 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GADD45AP24522 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GADD45AP24522 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GADD45AP24522 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GADD45AP24522 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GADD45AP24522 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GADD45AP24522 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GADD45AP24522 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GADD45AP24522 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GADD45AP24522 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GADD45AP24522 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GADD45AP24522 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GADD45AP24522 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GADD45AP24522 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GADD45AP24522 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GADD45AP24522 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GADD45AP24522 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GADD45AP24522 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GADD45AP24522 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GADD45AP24522 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GADD45AP24522 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GADD45AP24522 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GADD45AP24522 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GADD45AP24522 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GADD45AP24522 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GADD45AP24522 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GADD45AP24522 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GADD45AP24522 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GADD45AP24522 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GADD45AP24522 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GADD45AP24522 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GADD45AP24522 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GADD45AP24522 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GADD45AP24522 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GADD45AP24522 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GADD45AP24522 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GADD45AP24522 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GADD45AP24522 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GADD45AP24522 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GADD45AP24522 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GADD45AP24522 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GADD45AP24522 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GADD45AP24522 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GADD45AP24522 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GADD45AP24522 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GADD45AP24522 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GADD45AP24522 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GADD45AP24522 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GADD45AP24522 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GADD45AP24522 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GADD45AP24522 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GADD45AP24522 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GADD45AP24522 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GADD45AP24522 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GADD45AP24522 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GADD45AP24522 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GADD45AP24522 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GADD45AP24522 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GADD45AP24522 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GADD45AP24522 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GADD45AP24522 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GADD45AP24522 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GADD45AP24522 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GADD45AP24522 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GADD45AP24522 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GADD45AP24522 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GADD45AP24522 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GADD45AP24522 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GADD45AP24522 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GADD45AP24522 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GADD45AP24522 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GADD45AP24522 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GADD45AP24522 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GADD45AP24522 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GADD45AP24522 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GADD45AP24522 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms