Protein–RNA interactions for Protein: P22674

CCNO, Cyclin-O, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNOP22674 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNOP22674 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNOP22674 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNOP22674 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNOP22674 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNOP22674 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNOP22674 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNOP22674 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNOP22674 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCNOP22674 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCNOP22674 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNOP22674 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNOP22674 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNOP22674 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNOP22674 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNOP22674 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNOP22674 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNOP22674 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNOP22674 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNOP22674 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNOP22674 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNOP22674 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNOP22674 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNOP22674 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNOP22674 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNOP22674 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNOP22674 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNOP22674 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNOP22674 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNOP22674 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNOP22674 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNOP22674 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNOP22674 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNOP22674 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNOP22674 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNOP22674 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNOP22674 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNOP22674 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNOP22674 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNOP22674 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNOP22674 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNOP22674 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNOP22674 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNOP22674 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNOP22674 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNOP22674 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNOP22674 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNOP22674 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNOP22674 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNOP22674 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNOP22674 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNOP22674 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNOP22674 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNOP22674 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNOP22674 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNOP22674 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNOP22674 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNOP22674 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNOP22674 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNOP22674 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCNOP22674 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNOP22674 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNOP22674 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNOP22674 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNOP22674 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNOP22674 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNOP22674 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNOP22674 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNOP22674 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNOP22674 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNOP22674 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNOP22674 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNOP22674 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNOP22674 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNOP22674 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNOP22674 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNOP22674 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNOP22674 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNOP22674 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNOP22674 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNOP22674 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNOP22674 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCNOP22674 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCNOP22674 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNOP22674 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNOP22674 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNOP22674 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNOP22674 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNOP22674 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNOP22674 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNOP22674 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNOP22674 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNOP22674 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNOP22674 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNOP22674 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNOP22674 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNOP22674 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNOP22674 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNOP22674 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNOP22674 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms