Protein–RNA interactions for Protein: P20340

RAB6A, Ras-related protein Rab-6A, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6AP20340 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB6AP20340 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB6AP20340 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB6AP20340 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB6AP20340 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB6AP20340 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB6AP20340 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB6AP20340 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB6AP20340 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB6AP20340 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB6AP20340 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB6AP20340 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB6AP20340 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB6AP20340 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB6AP20340 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB6AP20340 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB6AP20340 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RAB6AP20340 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB6AP20340 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB6AP20340 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB6AP20340 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB6AP20340 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB6AP20340 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB6AP20340 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB6AP20340 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB6AP20340 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAB6AP20340 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB6AP20340 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB6AP20340 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB6AP20340 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB6AP20340 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB6AP20340 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB6AP20340 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB6AP20340 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB6AP20340 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB6AP20340 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB6AP20340 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB6AP20340 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB6AP20340 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB6AP20340 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB6AP20340 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB6AP20340 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB6AP20340 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB6AP20340 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB6AP20340 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB6AP20340 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB6AP20340 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB6AP20340 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB6AP20340 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB6AP20340 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB6AP20340 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB6AP20340 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB6AP20340 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB6AP20340 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB6AP20340 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB6AP20340 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB6AP20340 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB6AP20340 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB6AP20340 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB6AP20340 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB6AP20340 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB6AP20340 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB6AP20340 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB6AP20340 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB6AP20340 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB6AP20340 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB6AP20340 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB6AP20340 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB6AP20340 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB6AP20340 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB6AP20340 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB6AP20340 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB6AP20340 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB6AP20340 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB6AP20340 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB6AP20340 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB6AP20340 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB6AP20340 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB6AP20340 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB6AP20340 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB6AP20340 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB6AP20340 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB6AP20340 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB6AP20340 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB6AP20340 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB6AP20340 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB6AP20340 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RAB6AP20340 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB6AP20340 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB6AP20340 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB6AP20340 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB6AP20340 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB6AP20340 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB6AP20340 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB6AP20340 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB6AP20340 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB6AP20340 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB6AP20340 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB6AP20340 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB6AP20340 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms