Protein–RNA interactions for Protein: P17936

IGFBP3, Insulin-like growth factor-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGFBP3P17936 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGFBP3P17936 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
IGFBP3P17936 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGFBP3P17936 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGFBP3P17936 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGFBP3P17936 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGFBP3P17936 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
IGFBP3P17936 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGFBP3P17936 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGFBP3P17936 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGFBP3P17936 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
IGFBP3P17936 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGFBP3P17936 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGFBP3P17936 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGFBP3P17936 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGFBP3P17936 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGFBP3P17936 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGFBP3P17936 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGFBP3P17936 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGFBP3P17936 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGFBP3P17936 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGFBP3P17936 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGFBP3P17936 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGFBP3P17936 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGFBP3P17936 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGFBP3P17936 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGFBP3P17936 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGFBP3P17936 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGFBP3P17936 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGFBP3P17936 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
IGFBP3P17936 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGFBP3P17936 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGFBP3P17936 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGFBP3P17936 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGFBP3P17936 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGFBP3P17936 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGFBP3P17936 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGFBP3P17936 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGFBP3P17936 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGFBP3P17936 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGFBP3P17936 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGFBP3P17936 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGFBP3P17936 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGFBP3P17936 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGFBP3P17936 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGFBP3P17936 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGFBP3P17936 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGFBP3P17936 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGFBP3P17936 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGFBP3P17936 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGFBP3P17936 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGFBP3P17936 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGFBP3P17936 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGFBP3P17936 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGFBP3P17936 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IGFBP3P17936 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IGFBP3P17936 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGFBP3P17936 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGFBP3P17936 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGFBP3P17936 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IGFBP3P17936 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IGFBP3P17936 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IGFBP3P17936 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IGFBP3P17936 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IGFBP3P17936 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IGFBP3P17936 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IGFBP3P17936 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGFBP3P17936 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGFBP3P17936 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGFBP3P17936 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGFBP3P17936 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGFBP3P17936 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGFBP3P17936 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGFBP3P17936 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
IGFBP3P17936 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGFBP3P17936 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGFBP3P17936 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGFBP3P17936 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGFBP3P17936 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGFBP3P17936 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGFBP3P17936 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGFBP3P17936 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGFBP3P17936 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGFBP3P17936 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGFBP3P17936 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGFBP3P17936 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGFBP3P17936 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGFBP3P17936 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGFBP3P17936 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGFBP3P17936 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGFBP3P17936 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGFBP3P17936 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGFBP3P17936 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGFBP3P17936 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGFBP3P17936 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
IGFBP3P17936 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGFBP3P17936 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGFBP3P17936 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGFBP3P17936 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGFBP3P17936 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms