Protein–RNA interactions for Protein: P13591

NCAM1, Neural cell adhesion molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAM1P13591 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NCAM1P13591 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NCAM1P13591 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NCAM1P13591 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NCAM1P13591 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.57■■■□□ 2
NCAM1P13591 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NCAM1P13591 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NCAM1P13591 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NCAM1P13591 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NCAM1P13591 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NCAM1P13591 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NCAM1P13591 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NCAM1P13591 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NCAM1P13591 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NCAM1P13591 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.52■■■□□ 2
NCAM1P13591 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NCAM1P13591 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
NCAM1P13591 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NCAM1P13591 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NCAM1P13591 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NCAM1P13591 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NCAM1P13591 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
NCAM1P13591 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NCAM1P13591 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NCAM1P13591 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
NCAM1P13591 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NCAM1P13591 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NCAM1P13591 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NCAM1P13591 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NCAM1P13591 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NCAM1P13591 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NCAM1P13591 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
NCAM1P13591 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NCAM1P13591 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NCAM1P13591 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NCAM1P13591 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NCAM1P13591 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NCAM1P13591 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NCAM1P13591 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NCAM1P13591 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NCAM1P13591 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NCAM1P13591 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NCAM1P13591 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NCAM1P13591 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NCAM1P13591 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCAM1P13591 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCAM1P13591 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCAM1P13591 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCAM1P13591 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NCAM1P13591 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NCAM1P13591 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
NCAM1P13591 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NCAM1P13591 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NCAM1P13591 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NCAM1P13591 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NCAM1P13591 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NCAM1P13591 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NCAM1P13591 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NCAM1P13591 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NCAM1P13591 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NCAM1P13591 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NCAM1P13591 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NCAM1P13591 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NCAM1P13591 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NCAM1P13591 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NCAM1P13591 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NCAM1P13591 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NCAM1P13591 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NCAM1P13591 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NCAM1P13591 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NCAM1P13591 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NCAM1P13591 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
NCAM1P13591 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NCAM1P13591 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NCAM1P13591 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NCAM1P13591 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NCAM1P13591 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NCAM1P13591 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NCAM1P13591 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NCAM1P13591 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NCAM1P13591 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NCAM1P13591 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NCAM1P13591 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NCAM1P13591 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
NCAM1P13591 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NCAM1P13591 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NCAM1P13591 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NCAM1P13591 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NCAM1P13591 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NCAM1P13591 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NCAM1P13591 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
NCAM1P13591 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NCAM1P13591 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NCAM1P13591 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NCAM1P13591 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NCAM1P13591 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NCAM1P13591 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NCAM1P13591 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NCAM1P13591 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NCAM1P13591 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms