Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LYL1P12980 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LYL1P12980 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LYL1P12980 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LYL1P12980 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LYL1P12980 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LYL1P12980 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LYL1P12980 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LYL1P12980 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LYL1P12980 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LYL1P12980 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LYL1P12980 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LYL1P12980 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LYL1P12980 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LYL1P12980 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LYL1P12980 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LYL1P12980 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LYL1P12980 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LYL1P12980 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LYL1P12980 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LYL1P12980 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LYL1P12980 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LYL1P12980 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LYL1P12980 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LYL1P12980 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LYL1P12980 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LYL1P12980 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LYL1P12980 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LYL1P12980 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LYL1P12980 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LYL1P12980 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LYL1P12980 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LYL1P12980 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LYL1P12980 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LYL1P12980 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LYL1P12980 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LYL1P12980 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LYL1P12980 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LYL1P12980 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LYL1P12980 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LYL1P12980 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LYL1P12980 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LYL1P12980 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LYL1P12980 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LYL1P12980 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LYL1P12980 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LYL1P12980 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LYL1P12980 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LYL1P12980 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LYL1P12980 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LYL1P12980 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LYL1P12980 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LYL1P12980 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LYL1P12980 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LYL1P12980 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LYL1P12980 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LYL1P12980 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LYL1P12980 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LYL1P12980 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LYL1P12980 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LYL1P12980 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LYL1P12980 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LYL1P12980 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LYL1P12980 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LYL1P12980 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LYL1P12980 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LYL1P12980 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LYL1P12980 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LYL1P12980 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LYL1P12980 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LYL1P12980 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LYL1P12980 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LYL1P12980 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LYL1P12980 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LYL1P12980 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LYL1P12980 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LYL1P12980 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LYL1P12980 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LYL1P12980 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LYL1P12980 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LYL1P12980 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LYL1P12980 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LYL1P12980 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LYL1P12980 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LYL1P12980 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LYL1P12980 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LYL1P12980 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LYL1P12980 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LYL1P12980 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LYL1P12980 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LYL1P12980 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LYL1P12980 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LYL1P12980 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LYL1P12980 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LYL1P12980 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LYL1P12980 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LYL1P12980 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LYL1P12980 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LYL1P12980 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LYL1P12980 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms