Protein–RNA interactions for Protein: P12757

SKIL, Ski-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKILP12757 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SKILP12757 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SKILP12757 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SKILP12757 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SKILP12757 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SKILP12757 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SKILP12757 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SKILP12757 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SKILP12757 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SKILP12757 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
SKILP12757 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
SKILP12757 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SKILP12757 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SKILP12757 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
SKILP12757 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SKILP12757 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SKILP12757 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SKILP12757 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SKILP12757 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SKILP12757 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SKILP12757 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SKILP12757 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SKILP12757 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SKILP12757 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SKILP12757 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SKILP12757 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SKILP12757 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SKILP12757 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SKILP12757 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SKILP12757 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SKILP12757 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SKILP12757 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SKILP12757 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SKILP12757 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SKILP12757 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SKILP12757 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SKILP12757 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SKILP12757 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SKILP12757 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SKILP12757 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SKILP12757 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SKILP12757 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SKILP12757 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SKILP12757 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SKILP12757 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SKILP12757 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SKILP12757 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SKILP12757 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SKILP12757 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SKILP12757 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SKILP12757 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SKILP12757 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SKILP12757 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SKILP12757 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SKILP12757 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SKILP12757 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SKILP12757 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SKILP12757 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SKILP12757 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SKILP12757 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SKILP12757 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SKILP12757 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SKILP12757 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SKILP12757 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SKILP12757 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SKILP12757 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SKILP12757 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SKILP12757 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SKILP12757 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SKILP12757 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
SKILP12757 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SKILP12757 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SKILP12757 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SKILP12757 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SKILP12757 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SKILP12757 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SKILP12757 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SKILP12757 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SKILP12757 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SKILP12757 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SKILP12757 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SKILP12757 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SKILP12757 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SKILP12757 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SKILP12757 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SKILP12757 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SKILP12757 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
SKILP12757 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SKILP12757 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SKILP12757 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SKILP12757 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SKILP12757 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SKILP12757 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SKILP12757 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SKILP12757 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SKILP12757 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SKILP12757 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SKILP12757 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SKILP12757 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SKILP12757 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms