Protein–RNA interactions for Protein: P12644

BMP4, Bone morphogenetic protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP4P12644 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BMP4P12644 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BMP4P12644 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BMP4P12644 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BMP4P12644 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
BMP4P12644 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BMP4P12644 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BMP4P12644 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BMP4P12644 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BMP4P12644 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BMP4P12644 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BMP4P12644 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BMP4P12644 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BMP4P12644 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BMP4P12644 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BMP4P12644 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BMP4P12644 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
BMP4P12644 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BMP4P12644 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BMP4P12644 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BMP4P12644 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BMP4P12644 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BMP4P12644 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BMP4P12644 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BMP4P12644 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BMP4P12644 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BMP4P12644 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BMP4P12644 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BMP4P12644 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BMP4P12644 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BMP4P12644 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BMP4P12644 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BMP4P12644 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BMP4P12644 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BMP4P12644 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BMP4P12644 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BMP4P12644 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BMP4P12644 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BMP4P12644 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BMP4P12644 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
BMP4P12644 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BMP4P12644 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BMP4P12644 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BMP4P12644 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BMP4P12644 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BMP4P12644 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BMP4P12644 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
BMP4P12644 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
BMP4P12644 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BMP4P12644 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BMP4P12644 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BMP4P12644 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BMP4P12644 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BMP4P12644 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BMP4P12644 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BMP4P12644 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BMP4P12644 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BMP4P12644 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BMP4P12644 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BMP4P12644 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BMP4P12644 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BMP4P12644 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BMP4P12644 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BMP4P12644 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BMP4P12644 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BMP4P12644 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BMP4P12644 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BMP4P12644 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BMP4P12644 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BMP4P12644 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BMP4P12644 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BMP4P12644 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BMP4P12644 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
BMP4P12644 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BMP4P12644 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BMP4P12644 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BMP4P12644 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BMP4P12644 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BMP4P12644 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BMP4P12644 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BMP4P12644 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BMP4P12644 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
BMP4P12644 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BMP4P12644 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BMP4P12644 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BMP4P12644 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BMP4P12644 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BMP4P12644 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
BMP4P12644 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BMP4P12644 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BMP4P12644 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BMP4P12644 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BMP4P12644 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BMP4P12644 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BMP4P12644 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BMP4P12644 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BMP4P12644 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BMP4P12644 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BMP4P12644 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
BMP4P12644 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms