Protein–RNA interactions for Protein: P11712

CYP2C9, Cytochrome P450 2C9, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C9P11712 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CYP2C9P11712 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CYP2C9P11712 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CYP2C9P11712 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CYP2C9P11712 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CYP2C9P11712 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CYP2C9P11712 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CYP2C9P11712 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CYP2C9P11712 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CYP2C9P11712 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CYP2C9P11712 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CYP2C9P11712 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CYP2C9P11712 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CYP2C9P11712 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CYP2C9P11712 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CYP2C9P11712 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CYP2C9P11712 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CYP2C9P11712 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CYP2C9P11712 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CYP2C9P11712 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CYP2C9P11712 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CYP2C9P11712 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CYP2C9P11712 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CYP2C9P11712 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CYP2C9P11712 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CYP2C9P11712 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CYP2C9P11712 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CYP2C9P11712 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CYP2C9P11712 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CYP2C9P11712 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CYP2C9P11712 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CYP2C9P11712 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CYP2C9P11712 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CYP2C9P11712 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CYP2C9P11712 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CYP2C9P11712 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CYP2C9P11712 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CYP2C9P11712 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CYP2C9P11712 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CYP2C9P11712 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CYP2C9P11712 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CYP2C9P11712 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CYP2C9P11712 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CYP2C9P11712 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CYP2C9P11712 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CYP2C9P11712 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CYP2C9P11712 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CYP2C9P11712 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CYP2C9P11712 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CYP2C9P11712 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CYP2C9P11712 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CYP2C9P11712 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CYP2C9P11712 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CYP2C9P11712 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CYP2C9P11712 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CYP2C9P11712 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CYP2C9P11712 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CYP2C9P11712 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CYP2C9P11712 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CYP2C9P11712 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CYP2C9P11712 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CYP2C9P11712 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CYP2C9P11712 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CYP2C9P11712 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CYP2C9P11712 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CYP2C9P11712 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CYP2C9P11712 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CYP2C9P11712 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CYP2C9P11712 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CYP2C9P11712 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CYP2C9P11712 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CYP2C9P11712 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CYP2C9P11712 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CYP2C9P11712 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CYP2C9P11712 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CYP2C9P11712 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CYP2C9P11712 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CYP2C9P11712 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CYP2C9P11712 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CYP2C9P11712 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CYP2C9P11712 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CYP2C9P11712 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CYP2C9P11712 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CYP2C9P11712 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CYP2C9P11712 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CYP2C9P11712 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CYP2C9P11712 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CYP2C9P11712 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CYP2C9P11712 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CYP2C9P11712 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CYP2C9P11712 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CYP2C9P11712 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CYP2C9P11712 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CYP2C9P11712 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CYP2C9P11712 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CYP2C9P11712 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CYP2C9P11712 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CYP2C9P11712 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CYP2C9P11712 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CYP2C9P11712 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms