Protein–RNA interactions for Protein: P10398

ARAF, Serine/threonine-protein kinase A-Raf, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARAFP10398 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARAFP10398 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ARAFP10398 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARAFP10398 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARAFP10398 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARAFP10398 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARAFP10398 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARAFP10398 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARAFP10398 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ARAFP10398 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARAFP10398 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARAFP10398 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARAFP10398 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARAFP10398 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARAFP10398 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARAFP10398 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARAFP10398 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARAFP10398 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARAFP10398 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARAFP10398 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARAFP10398 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARAFP10398 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARAFP10398 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARAFP10398 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARAFP10398 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARAFP10398 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARAFP10398 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARAFP10398 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARAFP10398 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARAFP10398 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARAFP10398 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARAFP10398 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARAFP10398 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARAFP10398 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARAFP10398 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARAFP10398 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARAFP10398 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARAFP10398 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARAFP10398 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARAFP10398 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARAFP10398 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARAFP10398 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARAFP10398 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARAFP10398 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARAFP10398 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARAFP10398 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARAFP10398 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARAFP10398 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARAFP10398 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ARAFP10398 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARAFP10398 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARAFP10398 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARAFP10398 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARAFP10398 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARAFP10398 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARAFP10398 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARAFP10398 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARAFP10398 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARAFP10398 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ARAFP10398 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARAFP10398 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARAFP10398 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARAFP10398 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARAFP10398 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARAFP10398 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARAFP10398 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARAFP10398 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARAFP10398 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARAFP10398 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARAFP10398 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARAFP10398 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARAFP10398 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARAFP10398 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ARAFP10398 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARAFP10398 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARAFP10398 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARAFP10398 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARAFP10398 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARAFP10398 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARAFP10398 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ARAFP10398 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARAFP10398 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARAFP10398 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARAFP10398 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARAFP10398 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ARAFP10398 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARAFP10398 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARAFP10398 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARAFP10398 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARAFP10398 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARAFP10398 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARAFP10398 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARAFP10398 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARAFP10398 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARAFP10398 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ARAFP10398 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARAFP10398 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARAFP10398 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARAFP10398 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARAFP10398 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms