Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FAM228BP0C875 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FAM228BP0C875 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FAM228BP0C875 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FAM228BP0C875 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FAM228BP0C875 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.08■■■□□ 2.08
FAM228BP0C875 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FAM228BP0C875 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FAM228BP0C875 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
FAM228BP0C875 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FAM228BP0C875 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FAM228BP0C875 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FAM228BP0C875 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FAM228BP0C875 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FAM228BP0C875 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FAM228BP0C875 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FAM228BP0C875 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FAM228BP0C875 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FAM228BP0C875 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FAM228BP0C875 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FAM228BP0C875 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FAM228BP0C875 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FAM228BP0C875 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FAM228BP0C875 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FAM228BP0C875 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FAM228BP0C875 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FAM228BP0C875 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FAM228BP0C875 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FAM228BP0C875 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FAM228BP0C875 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
FAM228BP0C875 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FAM228BP0C875 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FAM228BP0C875 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FAM228BP0C875 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FAM228BP0C875 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
FAM228BP0C875 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FAM228BP0C875 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FAM228BP0C875 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FAM228BP0C875 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FAM228BP0C875 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
FAM228BP0C875 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
FAM228BP0C875 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
FAM228BP0C875 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
FAM228BP0C875 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FAM228BP0C875 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FAM228BP0C875 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FAM228BP0C875 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FAM228BP0C875 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FAM228BP0C875 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FAM228BP0C875 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
FAM228BP0C875 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FAM228BP0C875 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FAM228BP0C875 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FAM228BP0C875 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FAM228BP0C875 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FAM228BP0C875 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FAM228BP0C875 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
FAM228BP0C875 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
FAM228BP0C875 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
FAM228BP0C875 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FAM228BP0C875 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FAM228BP0C875 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FAM228BP0C875 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FAM228BP0C875 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FAM228BP0C875 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FAM228BP0C875 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
FAM228BP0C875 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
FAM228BP0C875 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FAM228BP0C875 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FAM228BP0C875 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FAM228BP0C875 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FAM228BP0C875 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FAM228BP0C875 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FAM228BP0C875 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FAM228BP0C875 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FAM228BP0C875 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FAM228BP0C875 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FAM228BP0C875 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FAM228BP0C875 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
FAM228BP0C875 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FAM228BP0C875 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
FAM228BP0C875 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FAM228BP0C875 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FAM228BP0C875 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FAM228BP0C875 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FAM228BP0C875 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FAM228BP0C875 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FAM228BP0C875 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FAM228BP0C875 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FAM228BP0C875 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FAM228BP0C875 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FAM228BP0C875 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FAM228BP0C875 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FAM228BP0C875 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FAM228BP0C875 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
FAM228BP0C875 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FAM228BP0C875 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FAM228BP0C875 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FAM228BP0C875 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FAM228BP0C875 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms