Protein–RNA interactions for Protein: P09012

SNRPA, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPAP09012 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SNRPAP09012 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SNRPAP09012 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SNRPAP09012 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SNRPAP09012 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SNRPAP09012 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNRPAP09012 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNRPAP09012 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNRPAP09012 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNRPAP09012 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SNRPAP09012 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SNRPAP09012 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SNRPAP09012 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNRPAP09012 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNRPAP09012 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNRPAP09012 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNRPAP09012 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SNRPAP09012 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNRPAP09012 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNRPAP09012 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNRPAP09012 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNRPAP09012 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNRPAP09012 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNRPAP09012 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SNRPAP09012 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNRPAP09012 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNRPAP09012 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNRPAP09012 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNRPAP09012 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNRPAP09012 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNRPAP09012 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNRPAP09012 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNRPAP09012 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SNRPAP09012 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SNRPAP09012 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SNRPAP09012 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNRPAP09012 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNRPAP09012 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNRPAP09012 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNRPAP09012 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SNRPAP09012 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNRPAP09012 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNRPAP09012 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNRPAP09012 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SNRPAP09012 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNRPAP09012 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNRPAP09012 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNRPAP09012 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNRPAP09012 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNRPAP09012 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNRPAP09012 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNRPAP09012 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNRPAP09012 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNRPAP09012 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SNRPAP09012 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SNRPAP09012 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SNRPAP09012 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SNRPAP09012 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SNRPAP09012 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SNRPAP09012 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SNRPAP09012 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SNRPAP09012 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SNRPAP09012 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SNRPAP09012 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SNRPAP09012 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SNRPAP09012 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SNRPAP09012 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SNRPAP09012 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNRPAP09012 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNRPAP09012 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNRPAP09012 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNRPAP09012 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNRPAP09012 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNRPAP09012 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNRPAP09012 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNRPAP09012 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNRPAP09012 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNRPAP09012 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNRPAP09012 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNRPAP09012 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SNRPAP09012 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNRPAP09012 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNRPAP09012 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNRPAP09012 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNRPAP09012 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNRPAP09012 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNRPAP09012 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNRPAP09012 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNRPAP09012 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNRPAP09012 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SNRPAP09012 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNRPAP09012 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNRPAP09012 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNRPAP09012 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNRPAP09012 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNRPAP09012 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNRPAP09012 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNRPAP09012 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNRPAP09012 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNRPAP09012 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms