Protein–RNA interactions for Protein: P08579

SNRPB2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPB2P08579 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNRPB2P08579 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNRPB2P08579 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNRPB2P08579 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNRPB2P08579 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNRPB2P08579 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNRPB2P08579 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNRPB2P08579 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNRPB2P08579 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNRPB2P08579 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNRPB2P08579 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNRPB2P08579 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SNRPB2P08579 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SNRPB2P08579 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNRPB2P08579 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNRPB2P08579 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNRPB2P08579 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNRPB2P08579 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNRPB2P08579 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNRPB2P08579 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SNRPB2P08579 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNRPB2P08579 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNRPB2P08579 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNRPB2P08579 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNRPB2P08579 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNRPB2P08579 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNRPB2P08579 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNRPB2P08579 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNRPB2P08579 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNRPB2P08579 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNRPB2P08579 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNRPB2P08579 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SNRPB2P08579 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNRPB2P08579 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNRPB2P08579 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNRPB2P08579 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNRPB2P08579 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNRPB2P08579 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNRPB2P08579 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNRPB2P08579 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNRPB2P08579 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNRPB2P08579 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNRPB2P08579 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNRPB2P08579 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNRPB2P08579 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNRPB2P08579 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNRPB2P08579 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNRPB2P08579 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNRPB2P08579 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNRPB2P08579 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNRPB2P08579 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNRPB2P08579 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNRPB2P08579 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SNRPB2P08579 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
SNRPB2P08579 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNRPB2P08579 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNRPB2P08579 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNRPB2P08579 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNRPB2P08579 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNRPB2P08579 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNRPB2P08579 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNRPB2P08579 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNRPB2P08579 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNRPB2P08579 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNRPB2P08579 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNRPB2P08579 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNRPB2P08579 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNRPB2P08579 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNRPB2P08579 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNRPB2P08579 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNRPB2P08579 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNRPB2P08579 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SNRPB2P08579 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SNRPB2P08579 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNRPB2P08579 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNRPB2P08579 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SNRPB2P08579 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNRPB2P08579 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNRPB2P08579 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNRPB2P08579 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNRPB2P08579 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNRPB2P08579 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNRPB2P08579 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNRPB2P08579 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SNRPB2P08579 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNRPB2P08579 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNRPB2P08579 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNRPB2P08579 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNRPB2P08579 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNRPB2P08579 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNRPB2P08579 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNRPB2P08579 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNRPB2P08579 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNRPB2P08579 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNRPB2P08579 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNRPB2P08579 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SNRPB2P08579 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNRPB2P08579 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNRPB2P08579 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNRPB2P08579 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms