Protein–RNA interactions for Protein: P06858

LPL, Lipoprotein lipase, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPLP06858 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LPLP06858 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LPLP06858 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LPLP06858 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LPLP06858 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LPLP06858 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LPLP06858 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LPLP06858 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LPLP06858 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LPLP06858 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LPLP06858 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LPLP06858 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LPLP06858 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LPLP06858 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LPLP06858 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LPLP06858 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LPLP06858 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LPLP06858 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LPLP06858 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LPLP06858 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LPLP06858 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LPLP06858 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LPLP06858 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LPLP06858 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LPLP06858 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LPLP06858 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LPLP06858 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LPLP06858 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LPLP06858 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LPLP06858 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LPLP06858 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LPLP06858 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
LPLP06858 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LPLP06858 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LPLP06858 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LPLP06858 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LPLP06858 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LPLP06858 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LPLP06858 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LPLP06858 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LPLP06858 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LPLP06858 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LPLP06858 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LPLP06858 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LPLP06858 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LPLP06858 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LPLP06858 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LPLP06858 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LPLP06858 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LPLP06858 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LPLP06858 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LPLP06858 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LPLP06858 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LPLP06858 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LPLP06858 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LPLP06858 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LPLP06858 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LPLP06858 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LPLP06858 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LPLP06858 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LPLP06858 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LPLP06858 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LPLP06858 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LPLP06858 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LPLP06858 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LPLP06858 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LPLP06858 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LPLP06858 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LPLP06858 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LPLP06858 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LPLP06858 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LPLP06858 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LPLP06858 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LPLP06858 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LPLP06858 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LPLP06858 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LPLP06858 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LPLP06858 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LPLP06858 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LPLP06858 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LPLP06858 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LPLP06858 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LPLP06858 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LPLP06858 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LPLP06858 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LPLP06858 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LPLP06858 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LPLP06858 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LPLP06858 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LPLP06858 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LPLP06858 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LPLP06858 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LPLP06858 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LPLP06858 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LPLP06858 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LPLP06858 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LPLP06858 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LPLP06858 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LPLP06858 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LPLP06858 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms