Protein–RNA interactions for Protein: P03891

MT-ND2, NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-ND2P03891 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MT-ND2P03891 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MT-ND2P03891 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MT-ND2P03891 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MT-ND2P03891 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MT-ND2P03891 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MT-ND2P03891 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MT-ND2P03891 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MT-ND2P03891 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MT-ND2P03891 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MT-ND2P03891 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MT-ND2P03891 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MT-ND2P03891 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MT-ND2P03891 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MT-ND2P03891 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MT-ND2P03891 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MT-ND2P03891 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MT-ND2P03891 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MT-ND2P03891 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MT-ND2P03891 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MT-ND2P03891 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MT-ND2P03891 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MT-ND2P03891 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MT-ND2P03891 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MT-ND2P03891 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MT-ND2P03891 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MT-ND2P03891 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MT-ND2P03891 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MT-ND2P03891 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MT-ND2P03891 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MT-ND2P03891 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MT-ND2P03891 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MT-ND2P03891 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MT-ND2P03891 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MT-ND2P03891 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MT-ND2P03891 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MT-ND2P03891 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MT-ND2P03891 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MT-ND2P03891 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MT-ND2P03891 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MT-ND2P03891 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MT-ND2P03891 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MT-ND2P03891 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MT-ND2P03891 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MT-ND2P03891 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MT-ND2P03891 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MT-ND2P03891 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MT-ND2P03891 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MT-ND2P03891 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MT-ND2P03891 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MT-ND2P03891 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MT-ND2P03891 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MT-ND2P03891 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MT-ND2P03891 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MT-ND2P03891 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MT-ND2P03891 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MT-ND2P03891 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MT-ND2P03891 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MT-ND2P03891 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MT-ND2P03891 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MT-ND2P03891 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MT-ND2P03891 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MT-ND2P03891 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MT-ND2P03891 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MT-ND2P03891 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MT-ND2P03891 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MT-ND2P03891 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MT-ND2P03891 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MT-ND2P03891 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MT-ND2P03891 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MT-ND2P03891 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MT-ND2P03891 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MT-ND2P03891 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MT-ND2P03891 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MT-ND2P03891 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MT-ND2P03891 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MT-ND2P03891 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MT-ND2P03891 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MT-ND2P03891 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MT-ND2P03891 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MT-ND2P03891 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MT-ND2P03891 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MT-ND2P03891 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MT-ND2P03891 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MT-ND2P03891 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MT-ND2P03891 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MT-ND2P03891 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MT-ND2P03891 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MT-ND2P03891 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MT-ND2P03891 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MT-ND2P03891 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MT-ND2P03891 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MT-ND2P03891 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MT-ND2P03891 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MT-ND2P03891 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MT-ND2P03891 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MT-ND2P03891 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MT-ND2P03891 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MT-ND2P03891 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MT-ND2P03891 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms