Protein–RNA interactions for Protein: P02585

TNNC2, Troponin C, skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNC2P02585 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TNNC2P02585 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TNNC2P02585 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TNNC2P02585 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TNNC2P02585 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
TNNC2P02585 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNNC2P02585 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNNC2P02585 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNNC2P02585 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNNC2P02585 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNNC2P02585 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNNC2P02585 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNNC2P02585 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNNC2P02585 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNNC2P02585 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TNNC2P02585 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TNNC2P02585 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNNC2P02585 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNNC2P02585 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNNC2P02585 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNNC2P02585 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TNNC2P02585 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TNNC2P02585 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TNNC2P02585 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TNNC2P02585 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TNNC2P02585 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TNNC2P02585 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TNNC2P02585 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TNNC2P02585 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TNNC2P02585 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TNNC2P02585 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TNNC2P02585 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNNC2P02585 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNNC2P02585 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TNNC2P02585 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TNNC2P02585 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TNNC2P02585 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNNC2P02585 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNNC2P02585 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNNC2P02585 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNNC2P02585 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNNC2P02585 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNNC2P02585 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNNC2P02585 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TNNC2P02585 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TNNC2P02585 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TNNC2P02585 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TNNC2P02585 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TNNC2P02585 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TNNC2P02585 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
TNNC2P02585 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TNNC2P02585 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TNNC2P02585 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TNNC2P02585 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TNNC2P02585 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TNNC2P02585 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TNNC2P02585 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TNNC2P02585 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TNNC2P02585 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
TNNC2P02585 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TNNC2P02585 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TNNC2P02585 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TNNC2P02585 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TNNC2P02585 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TNNC2P02585 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TNNC2P02585 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TNNC2P02585 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TNNC2P02585 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TNNC2P02585 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TNNC2P02585 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TNNC2P02585 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TNNC2P02585 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TNNC2P02585 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TNNC2P02585 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TNNC2P02585 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
TNNC2P02585 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TNNC2P02585 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
TNNC2P02585 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNNC2P02585 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNNC2P02585 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNNC2P02585 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNNC2P02585 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNNC2P02585 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNNC2P02585 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNNC2P02585 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNNC2P02585 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNNC2P02585 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNNC2P02585 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNNC2P02585 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNNC2P02585 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNNC2P02585 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNNC2P02585 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNNC2P02585 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNNC2P02585 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNNC2P02585 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNNC2P02585 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNNC2P02585 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNNC2P02585 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNNC2P02585 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNNC2P02585 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms