Protein–RNA interactions for Protein: O95832

CLDN1, Claudin-1, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN1O95832 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN1O95832 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN1O95832 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDN1O95832 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDN1O95832 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDN1O95832 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDN1O95832 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN1O95832 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN1O95832 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN1O95832 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN1O95832 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN1O95832 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN1O95832 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN1O95832 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN1O95832 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN1O95832 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN1O95832 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN1O95832 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN1O95832 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN1O95832 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN1O95832 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN1O95832 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN1O95832 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN1O95832 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN1O95832 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN1O95832 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN1O95832 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN1O95832 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN1O95832 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN1O95832 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN1O95832 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN1O95832 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN1O95832 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN1O95832 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN1O95832 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN1O95832 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN1O95832 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN1O95832 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN1O95832 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN1O95832 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN1O95832 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN1O95832 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN1O95832 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN1O95832 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN1O95832 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN1O95832 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN1O95832 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN1O95832 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN1O95832 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN1O95832 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN1O95832 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN1O95832 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CLDN1O95832 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN1O95832 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN1O95832 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN1O95832 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLDN1O95832 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLDN1O95832 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CLDN1O95832 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLDN1O95832 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLDN1O95832 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN1O95832 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN1O95832 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLDN1O95832 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLDN1O95832 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLDN1O95832 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLDN1O95832 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLDN1O95832 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLDN1O95832 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLDN1O95832 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLDN1O95832 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLDN1O95832 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLDN1O95832 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLDN1O95832 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLDN1O95832 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLDN1O95832 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLDN1O95832 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLDN1O95832 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLDN1O95832 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLDN1O95832 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLDN1O95832 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLDN1O95832 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLDN1O95832 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLDN1O95832 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLDN1O95832 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLDN1O95832 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLDN1O95832 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLDN1O95832 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLDN1O95832 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLDN1O95832 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLDN1O95832 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLDN1O95832 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLDN1O95832 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLDN1O95832 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CLDN1O95832 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLDN1O95832 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLDN1O95832 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLDN1O95832 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLDN1O95832 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLDN1O95832 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 370.2 ms