Protein–RNA interactions for Protein: O95104

SCAF4, Splicing factor, arginine/serine-rich 15, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF4O95104 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCAF4O95104 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCAF4O95104 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCAF4O95104 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCAF4O95104 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCAF4O95104 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCAF4O95104 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCAF4O95104 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCAF4O95104 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCAF4O95104 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCAF4O95104 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCAF4O95104 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SCAF4O95104 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCAF4O95104 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCAF4O95104 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCAF4O95104 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCAF4O95104 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCAF4O95104 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCAF4O95104 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCAF4O95104 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCAF4O95104 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCAF4O95104 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCAF4O95104 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCAF4O95104 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCAF4O95104 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCAF4O95104 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCAF4O95104 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCAF4O95104 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCAF4O95104 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCAF4O95104 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCAF4O95104 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCAF4O95104 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCAF4O95104 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCAF4O95104 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCAF4O95104 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCAF4O95104 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCAF4O95104 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCAF4O95104 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SCAF4O95104 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SCAF4O95104 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCAF4O95104 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCAF4O95104 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCAF4O95104 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCAF4O95104 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCAF4O95104 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCAF4O95104 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCAF4O95104 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCAF4O95104 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCAF4O95104 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCAF4O95104 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCAF4O95104 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCAF4O95104 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCAF4O95104 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCAF4O95104 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCAF4O95104 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCAF4O95104 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCAF4O95104 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCAF4O95104 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCAF4O95104 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCAF4O95104 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCAF4O95104 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCAF4O95104 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCAF4O95104 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCAF4O95104 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCAF4O95104 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCAF4O95104 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCAF4O95104 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCAF4O95104 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCAF4O95104 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCAF4O95104 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCAF4O95104 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCAF4O95104 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCAF4O95104 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCAF4O95104 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCAF4O95104 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCAF4O95104 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCAF4O95104 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCAF4O95104 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCAF4O95104 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCAF4O95104 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCAF4O95104 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCAF4O95104 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCAF4O95104 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SCAF4O95104 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCAF4O95104 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCAF4O95104 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCAF4O95104 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SCAF4O95104 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCAF4O95104 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCAF4O95104 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCAF4O95104 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SCAF4O95104 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SCAF4O95104 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SCAF4O95104 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SCAF4O95104 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SCAF4O95104 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SCAF4O95104 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SCAF4O95104 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SCAF4O95104 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SCAF4O95104 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.7 ms