Protein–RNA interactions for Protein: O94967

WDR47, WD repeat-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR47O94967 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
WDR47O94967 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
WDR47O94967 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
WDR47O94967 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
WDR47O94967 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
WDR47O94967 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
WDR47O94967 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
WDR47O94967 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
WDR47O94967 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
WDR47O94967 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
WDR47O94967 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
WDR47O94967 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
WDR47O94967 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
WDR47O94967 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
WDR47O94967 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
WDR47O94967 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
WDR47O94967 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
WDR47O94967 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
WDR47O94967 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
WDR47O94967 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
WDR47O94967 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
WDR47O94967 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
WDR47O94967 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
WDR47O94967 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
WDR47O94967 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
WDR47O94967 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
WDR47O94967 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
WDR47O94967 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
WDR47O94967 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
WDR47O94967 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
WDR47O94967 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
WDR47O94967 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
WDR47O94967 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
WDR47O94967 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
WDR47O94967 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
WDR47O94967 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
WDR47O94967 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
WDR47O94967 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
WDR47O94967 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
WDR47O94967 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
WDR47O94967 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
WDR47O94967 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
WDR47O94967 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
WDR47O94967 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
WDR47O94967 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
WDR47O94967 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
WDR47O94967 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
WDR47O94967 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
WDR47O94967 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
WDR47O94967 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
WDR47O94967 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
WDR47O94967 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
WDR47O94967 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
WDR47O94967 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
WDR47O94967 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
WDR47O94967 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
WDR47O94967 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
WDR47O94967 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
WDR47O94967 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
WDR47O94967 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
WDR47O94967 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
WDR47O94967 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
WDR47O94967 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
WDR47O94967 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
WDR47O94967 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
WDR47O94967 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
WDR47O94967 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
WDR47O94967 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
WDR47O94967 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
WDR47O94967 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
WDR47O94967 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
WDR47O94967 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
WDR47O94967 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
WDR47O94967 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
WDR47O94967 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
WDR47O94967 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
WDR47O94967 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
WDR47O94967 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
WDR47O94967 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
WDR47O94967 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
WDR47O94967 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
WDR47O94967 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
WDR47O94967 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
WDR47O94967 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
WDR47O94967 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
WDR47O94967 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
WDR47O94967 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
WDR47O94967 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
WDR47O94967 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
WDR47O94967 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
WDR47O94967 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
WDR47O94967 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
WDR47O94967 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
WDR47O94967 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
WDR47O94967 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
WDR47O94967 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
WDR47O94967 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
WDR47O94967 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
WDR47O94967 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
WDR47O94967 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms