Protein–RNA interactions for Protein: O94967

WDR47, WD repeat-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR47O94967 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
WDR47O94967 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
WDR47O94967 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
WDR47O94967 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
WDR47O94967 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
WDR47O94967 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
WDR47O94967 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
WDR47O94967 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
WDR47O94967 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
WDR47O94967 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
WDR47O94967 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
WDR47O94967 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
WDR47O94967 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
WDR47O94967 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
WDR47O94967 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
WDR47O94967 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
WDR47O94967 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
WDR47O94967 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
WDR47O94967 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
WDR47O94967 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
WDR47O94967 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
WDR47O94967 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
WDR47O94967 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
WDR47O94967 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
WDR47O94967 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
WDR47O94967 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
WDR47O94967 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
WDR47O94967 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
WDR47O94967 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
WDR47O94967 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
WDR47O94967 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
WDR47O94967 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
WDR47O94967 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
WDR47O94967 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
WDR47O94967 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
WDR47O94967 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
WDR47O94967 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
WDR47O94967 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
WDR47O94967 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
WDR47O94967 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
WDR47O94967 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
WDR47O94967 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
WDR47O94967 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
WDR47O94967 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
WDR47O94967 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
WDR47O94967 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
WDR47O94967 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
WDR47O94967 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
WDR47O94967 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
WDR47O94967 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
WDR47O94967 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
WDR47O94967 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
WDR47O94967 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
WDR47O94967 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
WDR47O94967 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
WDR47O94967 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
WDR47O94967 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
WDR47O94967 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
WDR47O94967 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
WDR47O94967 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
WDR47O94967 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
WDR47O94967 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
WDR47O94967 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
WDR47O94967 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
WDR47O94967 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
WDR47O94967 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
WDR47O94967 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
WDR47O94967 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
WDR47O94967 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
WDR47O94967 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
WDR47O94967 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
WDR47O94967 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
WDR47O94967 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
WDR47O94967 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
WDR47O94967 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
WDR47O94967 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
WDR47O94967 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
WDR47O94967 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
WDR47O94967 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
WDR47O94967 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
WDR47O94967 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
WDR47O94967 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
WDR47O94967 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
WDR47O94967 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
WDR47O94967 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
WDR47O94967 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
WDR47O94967 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
WDR47O94967 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
WDR47O94967 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
WDR47O94967 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
WDR47O94967 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
WDR47O94967 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
WDR47O94967 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
WDR47O94967 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
WDR47O94967 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
WDR47O94967 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
WDR47O94967 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
WDR47O94967 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
WDR47O94967 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
WDR47O94967 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms