Protein–RNA interactions for Protein: O75581

LRP6, Low-density lipoprotein receptor-related protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP6O75581 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
LRP6O75581 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
LRP6O75581 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
LRP6O75581 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
LRP6O75581 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
LRP6O75581 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
LRP6O75581 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
LRP6O75581 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
LRP6O75581 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
LRP6O75581 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
LRP6O75581 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
LRP6O75581 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
LRP6O75581 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
LRP6O75581 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
LRP6O75581 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
LRP6O75581 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC36.57■■■■□ 3.44
LRP6O75581 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC36.57■■■■□ 3.44
LRP6O75581 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
LRP6O75581 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
LRP6O75581 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
LRP6O75581 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC36.53■■■■□ 3.44
LRP6O75581 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
LRP6O75581 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
LRP6O75581 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
LRP6O75581 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
LRP6O75581 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
LRP6O75581 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
LRP6O75581 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
LRP6O75581 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
LRP6O75581 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC36.5■■■■□ 3.43
LRP6O75581 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
LRP6O75581 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
LRP6O75581 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
LRP6O75581 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
LRP6O75581 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
LRP6O75581 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
LRP6O75581 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
LRP6O75581 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
LRP6O75581 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
LRP6O75581 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.42
LRP6O75581 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
LRP6O75581 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
LRP6O75581 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
LRP6O75581 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
LRP6O75581 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
LRP6O75581 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
LRP6O75581 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
LRP6O75581 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
LRP6O75581 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
LRP6O75581 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
LRP6O75581 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
LRP6O75581 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
LRP6O75581 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
LRP6O75581 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
LRP6O75581 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
LRP6O75581 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.4
LRP6O75581 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC36.32■■■■□ 3.4
LRP6O75581 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
LRP6O75581 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
LRP6O75581 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
LRP6O75581 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
LRP6O75581 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
LRP6O75581 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
LRP6O75581 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
LRP6O75581 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
LRP6O75581 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
LRP6O75581 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
LRP6O75581 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.39
LRP6O75581 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
LRP6O75581 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
LRP6O75581 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
LRP6O75581 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
LRP6O75581 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
LRP6O75581 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.21■■■■□ 3.39
LRP6O75581 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC36.21■■■■□ 3.39
LRP6O75581 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
LRP6O75581 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
LRP6O75581 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
LRP6O75581 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
LRP6O75581 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC36.19■■■■□ 3.38
LRP6O75581 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC36.19■■■■□ 3.38
LRP6O75581 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
LRP6O75581 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
LRP6O75581 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
LRP6O75581 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
LRP6O75581 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
LRP6O75581 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
LRP6O75581 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
LRP6O75581 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
LRP6O75581 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
LRP6O75581 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
LRP6O75581 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC36.1■■■■□ 3.37
LRP6O75581 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
LRP6O75581 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
LRP6O75581 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
LRP6O75581 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
LRP6O75581 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
LRP6O75581 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
LRP6O75581 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
LRP6O75581 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms