Protein–RNA interactions for Protein: O75326

SEMA7A, Semaphorin-7A, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA7AO75326 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEMA7AO75326 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEMA7AO75326 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEMA7AO75326 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEMA7AO75326 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEMA7AO75326 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA7AO75326 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA7AO75326 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA7AO75326 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA7AO75326 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA7AO75326 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA7AO75326 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA7AO75326 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA7AO75326 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA7AO75326 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA7AO75326 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA7AO75326 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA7AO75326 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA7AO75326 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA7AO75326 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA7AO75326 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA7AO75326 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA7AO75326 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA7AO75326 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA7AO75326 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA7AO75326 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA7AO75326 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA7AO75326 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEMA7AO75326 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEMA7AO75326 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEMA7AO75326 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEMA7AO75326 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEMA7AO75326 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEMA7AO75326 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEMA7AO75326 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEMA7AO75326 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEMA7AO75326 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEMA7AO75326 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEMA7AO75326 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEMA7AO75326 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEMA7AO75326 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEMA7AO75326 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEMA7AO75326 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEMA7AO75326 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SEMA7AO75326 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEMA7AO75326 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA7AO75326 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA7AO75326 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA7AO75326 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA7AO75326 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA7AO75326 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA7AO75326 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEMA7AO75326 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SEMA7AO75326 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SEMA7AO75326 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SEMA7AO75326 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEMA7AO75326 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEMA7AO75326 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEMA7AO75326 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEMA7AO75326 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEMA7AO75326 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEMA7AO75326 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEMA7AO75326 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEMA7AO75326 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEMA7AO75326 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEMA7AO75326 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEMA7AO75326 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEMA7AO75326 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEMA7AO75326 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEMA7AO75326 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEMA7AO75326 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
SEMA7AO75326 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SEMA7AO75326 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SEMA7AO75326 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SEMA7AO75326 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEMA7AO75326 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEMA7AO75326 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA7AO75326 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA7AO75326 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA7AO75326 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA7AO75326 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA7AO75326 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA7AO75326 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA7AO75326 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA7AO75326 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA7AO75326 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA7AO75326 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA7AO75326 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA7AO75326 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA7AO75326 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA7AO75326 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA7AO75326 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA7AO75326 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA7AO75326 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA7AO75326 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA7AO75326 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA7AO75326 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA7AO75326 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEMA7AO75326 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEMA7AO75326 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.5 ms