Protein–RNA interactions for Protein: O60840

CACNA1F, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1F, humanhuman

Predictions only

Length 1,977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1FO60840 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CACNA1FO60840 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CACNA1FO60840 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CACNA1FO60840 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CACNA1FO60840 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CACNA1FO60840 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CACNA1FO60840 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CACNA1FO60840 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CACNA1FO60840 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CACNA1FO60840 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CACNA1FO60840 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CACNA1FO60840 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CACNA1FO60840 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CACNA1FO60840 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CACNA1FO60840 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CACNA1FO60840 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CACNA1FO60840 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CACNA1FO60840 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CACNA1FO60840 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CACNA1FO60840 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CACNA1FO60840 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CACNA1FO60840 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CACNA1FO60840 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CACNA1FO60840 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CACNA1FO60840 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CACNA1FO60840 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CACNA1FO60840 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CACNA1FO60840 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CACNA1FO60840 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
CACNA1FO60840 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CACNA1FO60840 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CACNA1FO60840 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CACNA1FO60840 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CACNA1FO60840 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
CACNA1FO60840 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
CACNA1FO60840 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CACNA1FO60840 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CACNA1FO60840 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CACNA1FO60840 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CACNA1FO60840 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CACNA1FO60840 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CACNA1FO60840 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CACNA1FO60840 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CACNA1FO60840 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CACNA1FO60840 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CACNA1FO60840 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CACNA1FO60840 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CACNA1FO60840 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CACNA1FO60840 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CACNA1FO60840 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CACNA1FO60840 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
CACNA1FO60840 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CACNA1FO60840 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CACNA1FO60840 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CACNA1FO60840 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CACNA1FO60840 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CACNA1FO60840 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
CACNA1FO60840 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CACNA1FO60840 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CACNA1FO60840 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CACNA1FO60840 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CACNA1FO60840 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CACNA1FO60840 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CACNA1FO60840 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CACNA1FO60840 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CACNA1FO60840 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CACNA1FO60840 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CACNA1FO60840 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CACNA1FO60840 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CACNA1FO60840 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CACNA1FO60840 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CACNA1FO60840 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CACNA1FO60840 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CACNA1FO60840 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CACNA1FO60840 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CACNA1FO60840 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CACNA1FO60840 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CACNA1FO60840 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CACNA1FO60840 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
CACNA1FO60840 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CACNA1FO60840 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CACNA1FO60840 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CACNA1FO60840 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
CACNA1FO60840 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CACNA1FO60840 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CACNA1FO60840 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CACNA1FO60840 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CACNA1FO60840 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CACNA1FO60840 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CACNA1FO60840 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
CACNA1FO60840 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
CACNA1FO60840 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
CACNA1FO60840 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
CACNA1FO60840 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CACNA1FO60840 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CACNA1FO60840 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
CACNA1FO60840 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CACNA1FO60840 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CACNA1FO60840 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CACNA1FO60840 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms