Protein–RNA interactions for Protein: O60359

CACNG3, Voltage-dependent calcium channel gamma-3 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG3O60359 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CACNG3O60359 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CACNG3O60359 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CACNG3O60359 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CACNG3O60359 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CACNG3O60359 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CACNG3O60359 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CACNG3O60359 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CACNG3O60359 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CACNG3O60359 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CACNG3O60359 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CACNG3O60359 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CACNG3O60359 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CACNG3O60359 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CACNG3O60359 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CACNG3O60359 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CACNG3O60359 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CACNG3O60359 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CACNG3O60359 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CACNG3O60359 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CACNG3O60359 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CACNG3O60359 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CACNG3O60359 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CACNG3O60359 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CACNG3O60359 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CACNG3O60359 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CACNG3O60359 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CACNG3O60359 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CACNG3O60359 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CACNG3O60359 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CACNG3O60359 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CACNG3O60359 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CACNG3O60359 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CACNG3O60359 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CACNG3O60359 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CACNG3O60359 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CACNG3O60359 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CACNG3O60359 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CACNG3O60359 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CACNG3O60359 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CACNG3O60359 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CACNG3O60359 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CACNG3O60359 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CACNG3O60359 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CACNG3O60359 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CACNG3O60359 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CACNG3O60359 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CACNG3O60359 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CACNG3O60359 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CACNG3O60359 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CACNG3O60359 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CACNG3O60359 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CACNG3O60359 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CACNG3O60359 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CACNG3O60359 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CACNG3O60359 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CACNG3O60359 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CACNG3O60359 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CACNG3O60359 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CACNG3O60359 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CACNG3O60359 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CACNG3O60359 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CACNG3O60359 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CACNG3O60359 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CACNG3O60359 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CACNG3O60359 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CACNG3O60359 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CACNG3O60359 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CACNG3O60359 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CACNG3O60359 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CACNG3O60359 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CACNG3O60359 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CACNG3O60359 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CACNG3O60359 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CACNG3O60359 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CACNG3O60359 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CACNG3O60359 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CACNG3O60359 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CACNG3O60359 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CACNG3O60359 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CACNG3O60359 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CACNG3O60359 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CACNG3O60359 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CACNG3O60359 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CACNG3O60359 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CACNG3O60359 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CACNG3O60359 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CACNG3O60359 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CACNG3O60359 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CACNG3O60359 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CACNG3O60359 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CACNG3O60359 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CACNG3O60359 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CACNG3O60359 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CACNG3O60359 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CACNG3O60359 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CACNG3O60359 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CACNG3O60359 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CACNG3O60359 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CACNG3O60359 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms