Protein–RNA interactions for Protein: O43933

PEX1, Peroxisome biogenesis factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX1O43933 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PEX1O43933 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PEX1O43933 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PEX1O43933 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PEX1O43933 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PEX1O43933 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PEX1O43933 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PEX1O43933 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PEX1O43933 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PEX1O43933 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PEX1O43933 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PEX1O43933 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PEX1O43933 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PEX1O43933 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PEX1O43933 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PEX1O43933 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PEX1O43933 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PEX1O43933 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PEX1O43933 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PEX1O43933 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PEX1O43933 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PEX1O43933 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PEX1O43933 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PEX1O43933 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PEX1O43933 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PEX1O43933 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PEX1O43933 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PEX1O43933 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PEX1O43933 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PEX1O43933 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PEX1O43933 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PEX1O43933 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PEX1O43933 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PEX1O43933 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PEX1O43933 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PEX1O43933 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PEX1O43933 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PEX1O43933 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PEX1O43933 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PEX1O43933 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PEX1O43933 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PEX1O43933 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PEX1O43933 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PEX1O43933 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PEX1O43933 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PEX1O43933 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PEX1O43933 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PEX1O43933 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PEX1O43933 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PEX1O43933 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PEX1O43933 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PEX1O43933 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PEX1O43933 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PEX1O43933 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PEX1O43933 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PEX1O43933 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PEX1O43933 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PEX1O43933 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PEX1O43933 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PEX1O43933 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PEX1O43933 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PEX1O43933 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PEX1O43933 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PEX1O43933 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PEX1O43933 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PEX1O43933 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PEX1O43933 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PEX1O43933 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PEX1O43933 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PEX1O43933 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PEX1O43933 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PEX1O43933 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PEX1O43933 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PEX1O43933 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PEX1O43933 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PEX1O43933 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PEX1O43933 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PEX1O43933 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PEX1O43933 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PEX1O43933 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PEX1O43933 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PEX1O43933 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PEX1O43933 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PEX1O43933 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PEX1O43933 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PEX1O43933 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PEX1O43933 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PEX1O43933 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PEX1O43933 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PEX1O43933 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PEX1O43933 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PEX1O43933 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PEX1O43933 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PEX1O43933 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PEX1O43933 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PEX1O43933 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PEX1O43933 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PEX1O43933 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PEX1O43933 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PEX1O43933 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms