Protein–RNA interactions for Protein: O43868

SLC28A2, Sodium/nucleoside cotransporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A2O43868 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC28A2O43868 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC28A2O43868 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC28A2O43868 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC28A2O43868 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC28A2O43868 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC28A2O43868 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC28A2O43868 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC28A2O43868 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC28A2O43868 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC28A2O43868 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC28A2O43868 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC28A2O43868 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC28A2O43868 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC28A2O43868 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC28A2O43868 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC28A2O43868 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC28A2O43868 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC28A2O43868 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC28A2O43868 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC28A2O43868 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC28A2O43868 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC28A2O43868 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC28A2O43868 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC28A2O43868 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC28A2O43868 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC28A2O43868 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC28A2O43868 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC28A2O43868 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC28A2O43868 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC28A2O43868 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC28A2O43868 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC28A2O43868 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC28A2O43868 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC28A2O43868 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC28A2O43868 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC28A2O43868 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC28A2O43868 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC28A2O43868 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC28A2O43868 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC28A2O43868 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC28A2O43868 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC28A2O43868 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC28A2O43868 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC28A2O43868 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC28A2O43868 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC28A2O43868 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC28A2O43868 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC28A2O43868 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC28A2O43868 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC28A2O43868 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC28A2O43868 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC28A2O43868 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC28A2O43868 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC28A2O43868 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC28A2O43868 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC28A2O43868 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC28A2O43868 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC28A2O43868 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC28A2O43868 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC28A2O43868 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC28A2O43868 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC28A2O43868 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC28A2O43868 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC28A2O43868 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC28A2O43868 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC28A2O43868 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC28A2O43868 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC28A2O43868 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC28A2O43868 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC28A2O43868 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC28A2O43868 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC28A2O43868 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC28A2O43868 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC28A2O43868 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC28A2O43868 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC28A2O43868 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC28A2O43868 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC28A2O43868 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC28A2O43868 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC28A2O43868 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC28A2O43868 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC28A2O43868 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC28A2O43868 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC28A2O43868 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC28A2O43868 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC28A2O43868 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC28A2O43868 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC28A2O43868 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC28A2O43868 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC28A2O43868 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC28A2O43868 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC28A2O43868 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC28A2O43868 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC28A2O43868 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC28A2O43868 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC28A2O43868 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC28A2O43868 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC28A2O43868 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC28A2O43868 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms