Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HTRA2O43464 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
HTRA2O43464 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HTRA2O43464 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HTRA2O43464 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HTRA2O43464 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HTRA2O43464 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HTRA2O43464 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HTRA2O43464 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HTRA2O43464 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HTRA2O43464 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
HTRA2O43464 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HTRA2O43464 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HTRA2O43464 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HTRA2O43464 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HTRA2O43464 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HTRA2O43464 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HTRA2O43464 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HTRA2O43464 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HTRA2O43464 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
HTRA2O43464 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HTRA2O43464 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HTRA2O43464 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HTRA2O43464 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HTRA2O43464 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HTRA2O43464 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HTRA2O43464 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
HTRA2O43464 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HTRA2O43464 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HTRA2O43464 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HTRA2O43464 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HTRA2O43464 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HTRA2O43464 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
HTRA2O43464 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HTRA2O43464 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HTRA2O43464 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HTRA2O43464 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HTRA2O43464 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HTRA2O43464 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HTRA2O43464 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HTRA2O43464 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HTRA2O43464 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HTRA2O43464 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HTRA2O43464 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HTRA2O43464 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HTRA2O43464 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HTRA2O43464 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
HTRA2O43464 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HTRA2O43464 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HTRA2O43464 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HTRA2O43464 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HTRA2O43464 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HTRA2O43464 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HTRA2O43464 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HTRA2O43464 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HTRA2O43464 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HTRA2O43464 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HTRA2O43464 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HTRA2O43464 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HTRA2O43464 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HTRA2O43464 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HTRA2O43464 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HTRA2O43464 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HTRA2O43464 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HTRA2O43464 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HTRA2O43464 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HTRA2O43464 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HTRA2O43464 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HTRA2O43464 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HTRA2O43464 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HTRA2O43464 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HTRA2O43464 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HTRA2O43464 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HTRA2O43464 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HTRA2O43464 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HTRA2O43464 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HTRA2O43464 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HTRA2O43464 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HTRA2O43464 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HTRA2O43464 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HTRA2O43464 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
HTRA2O43464 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HTRA2O43464 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
HTRA2O43464 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HTRA2O43464 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HTRA2O43464 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HTRA2O43464 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
HTRA2O43464 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HTRA2O43464 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HTRA2O43464 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HTRA2O43464 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HTRA2O43464 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HTRA2O43464 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HTRA2O43464 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HTRA2O43464 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HTRA2O43464 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HTRA2O43464 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HTRA2O43464 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HTRA2O43464 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HTRA2O43464 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms