Protein–RNA interactions for Protein: O43313

ATMIN, ATM interactor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMINO43313 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATMINO43313 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATMINO43313 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATMINO43313 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATMINO43313 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATMINO43313 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
ATMINO43313 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATMINO43313 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATMINO43313 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATMINO43313 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATMINO43313 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATMINO43313 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATMINO43313 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATMINO43313 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATMINO43313 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATMINO43313 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATMINO43313 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATMINO43313 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATMINO43313 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATMINO43313 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATMINO43313 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATMINO43313 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATMINO43313 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATMINO43313 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATMINO43313 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATMINO43313 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATMINO43313 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATMINO43313 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATMINO43313 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATMINO43313 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATMINO43313 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATMINO43313 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
ATMINO43313 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATMINO43313 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATMINO43313 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATMINO43313 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATMINO43313 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATMINO43313 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATMINO43313 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATMINO43313 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATMINO43313 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATMINO43313 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATMINO43313 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATMINO43313 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATMINO43313 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATMINO43313 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATMINO43313 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATMINO43313 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATMINO43313 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATMINO43313 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATMINO43313 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATMINO43313 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATMINO43313 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
ATMINO43313 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATMINO43313 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATMINO43313 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATMINO43313 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATMINO43313 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATMINO43313 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATMINO43313 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATMINO43313 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATMINO43313 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATMINO43313 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATMINO43313 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATMINO43313 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATMINO43313 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATMINO43313 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATMINO43313 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATMINO43313 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATMINO43313 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATMINO43313 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATMINO43313 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATMINO43313 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ATMINO43313 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATMINO43313 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATMINO43313 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
ATMINO43313 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
ATMINO43313 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ATMINO43313 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATMINO43313 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ATMINO43313 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ATMINO43313 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATMINO43313 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ATMINO43313 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATMINO43313 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ATMINO43313 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ATMINO43313 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATMINO43313 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATMINO43313 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATMINO43313 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ATMINO43313 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ATMINO43313 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATMINO43313 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATMINO43313 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATMINO43313 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATMINO43313 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATMINO43313 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATMINO43313 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATMINO43313 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ATMINO43313 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms