Protein–RNA interactions for Protein: O43251

RBFOX2, RNA binding protein fox-1 homolog 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBFOX2O43251 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.564e-17■■■■■ 59.9
RBFOX2O43251 MRPS6-205ENST00000488492 909 ntTSL 54.27□□□□□ -1.734e-17■■■■■ 59.9
RBFOX2O43251 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.944e-17■■■■■ 59.9
RBFOX2O43251 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.195e-7■■■■■ 59.6
RBFOX2O43251 RTEL1-TNFRSF6B-203ENST00000492259 4824 ntAPPRIS ALT2 TSL 513.34□□□□□ -0.275e-7■■■■■ 59.6
RBFOX2O43251 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.395e-7■■■■■ 59.6
RBFOX2O43251 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.395e-7■■■■■ 59.6
RBFOX2O43251 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.455e-7■■■■■ 59.6
RBFOX2O43251 RTEL1-211ENST00000508582 4273 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.725e-7■■■■■ 59.6
RBFOX2O43251 AP1G2-213ENST00000554816 297 ntTSL 410.4□□□□□ -0.744e-21■■■■■ 59
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RBFOX2O43251 AP1G2-233ENST00000557482 728 ntTSL 59.29□□□□□ -0.924e-21■■■■■ 59
RBFOX2O43251 AP1G2-220ENST00000555896 927 ntTSL 1 (best)9.06□□□□□ -0.964e-21■■■■■ 59
RBFOX2O43251 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.291e-14■■■■■ 58.9
RBFOX2O43251 ABCA2-217ENST00000479446 6295 ntTSL 1 (best)16.55■□□□□ 0.243e-9■■■■■ 58.5
RBFOX2O43251 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.287e-16■■■■■ 58.5
RBFOX2O43251 SNX27-202ENST00000368841 7070 ntTSL 1 (best)15.54■□□□□ 0.087e-16■■■■■ 58.5
RBFOX2O43251 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.037e-16■■■■■ 58.5
RBFOX2O43251 FGFR3-209ENST00000507588 336 ntTSL 1 (best)14.25□□□□□ -0.133e-20■■■■■ 58.2
RBFOX2O43251 YARS-207ENST00000481895 1018 ntTSL 515.49■□□□□ 0.075e-17■■■■■ 58.2
RBFOX2O43251 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.255e-17■■■■■ 58.2
RBFOX2O43251 YARS-206ENST00000478828 1044 ntTSL 28.25□□□□□ -1.095e-17■■■■■ 58.2
RBFOX2O43251 YARS-210ENST00000616261 1167 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.295e-17■■■■■ 58.2
RBFOX2O43251 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.112e-6■■■■■ 57.5
RBFOX2O43251 SLC25A43-203ENST00000488158 2699 ntTSL 215.71■□□□□ 0.112e-6■■■■■ 57.5
RBFOX2O43251 SLC25A43-204ENST00000493093 896 ntTSL 315.57■□□□□ 0.082e-6■■■■■ 57.5
RBFOX2O43251 SLC25A43-202ENST00000484058 358 ntTSL 26.13□□□□□ -1.432e-6■■■■■ 57.5
RBFOX2O43251 TBC1D9B-209ENST00000519757 1208 ntTSL 215.68■□□□□ 0.15e-13■■■■■ 57.5
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RBFOX2O43251 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.255e-13■■■■■ 57.5
RBFOX2O43251 TBC1D9B-212ENST00000521469 2741 ntTSL 1 (best)12.86□□□□□ -0.355e-13■■■■■ 57.5
RBFOX2O43251 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.535e-13■■■■■ 57.5
RBFOX2O43251 TBC1D9B-217ENST00000522472 668 ntTSL 510.92□□□□□ -0.665e-13■■■■■ 57.5
RBFOX2O43251 TBC1D9B-215ENST00000522180 562 ntTSL 49.08□□□□□ -0.965e-13■■■■■ 57.5
RBFOX2O43251 TBC1D9B-219ENST00000524222 927 ntTSL 58.56□□□□□ -1.045e-13■■■■■ 57.5
RBFOX2O43251 ULK1-204ENST00000540647 1211 ntTSL 215.11■□□□□ 0.012e-16■■■■■ 57.3
RBFOX2O43251 INTS6L-203ENST00000481908 3528 ntTSL 211.35□□□□□ -0.591e-12■■■■■ 57.2
RBFOX2O43251 INTS6L-201ENST00000370752 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.71e-12■■■■■ 57.2
RBFOX2O43251 INTS6L-206ENST00000639893 3904 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.781e-12■■■■■ 57.2
RBFOX2O43251 INTS6L-204ENST00000493637 6710 ntTSL 1 (best)3.52□□□□□ -1.851e-12■■■■■ 57.2
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RBFOX2O43251 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.491e-16■■■■■ 57.2
RBFOX2O43251 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.451e-16■■■■■ 57.2
RBFOX2O43251 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.041e-16■■■■■ 57.2
RBFOX2O43251 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.221e-16■■■■■ 57.2
RBFOX2O43251 TRIM24-206ENST00000497516 1515 ntTSL 511.49□□□□□ -0.571e-16■■■■■ 57.2
RBFOX2O43251 REST-208ENST00000619101 7114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.681e-16■■■■■ 57.2
RBFOX2O43251 HMGA2-209ENST00000539662 485 ntTSL 38.27□□□□□ -1.091e-16■■■■■ 57.2
RBFOX2O43251 REST-201ENST00000309042 7300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.451e-16■■■■■ 57.2
RBFOX2O43251 AGRN-202ENST00000419249 861 ntTSL 314.41□□□□□ -0.15e-10■■■■■ 57.1
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RBFOX2O43251 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.273e-8■■■■■ 56.9
RBFOX2O43251 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.153e-8■■■■■ 56.9
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RBFOX2O43251 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.73e-7■■■■■ 56.6
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RBFOX2O43251 SLC7A6-212ENST00000567325 658 ntTSL 26.6□□□□□ -1.352e-16■■■■■ 56.4
RBFOX2O43251 SLC7A6-216ENST00000618043 6124 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.432e-16■■■■■ 56.4
RBFOX2O43251 SLC7A6-209ENST00000566454 6308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.442e-16■■■■■ 56.4
RBFOX2O43251 PKD1P5-202ENST00000538166 606 ntTSL 315.1■□□□□ 0.011e-23■■■■■ 56.1
RBFOX2O43251 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC14.25□□□□□ -0.131e-23■■■■■ 56.1
RBFOX2O43251 PKD1P5-203ENST00000542593 761 ntTSL 513.22□□□□□ -0.291e-23■■■■■ 56.1
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RBFOX2O43251 NSD2-206ENST00000382895 7827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.637e-14■■■■■ 55.8
RBFOX2O43251 NSD2-210ENST00000482415 3602 ntTSL 1 (best)10.35□□□□□ -0.757e-14■■■■■ 55.8
RBFOX2O43251 NSD2-205ENST00000382892 7706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.757e-14■■■■■ 55.8
RBFOX2O43251 NSD2-202ENST00000353275 7980 ntTSL 1 (best)9.82□□□□□ -0.847e-14■■■■■ 55.8
RBFOX2O43251 NSD2-201ENST00000312087 8050 ntTSL 1 (best)9.11□□□□□ -0.957e-14■■■■■ 55.8
RBFOX2O43251 NSD2-219ENST00000508803 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.267e-14■■■■■ 55.8
RBFOX2O43251 TFG-207ENST00000487505 913 ntTSL 315.07■□□□□ 07e-12■■■■■ 55.8
RBFOX2O43251 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.982e-9■■■■■ 55.6
RBFOX2O43251 FAAH-203ENST00000484697 1046 ntTSL 1 (best)11.8□□□□□ -0.522e-9■■■■■ 55.6
RBFOX2O43251 FAAH-205ENST00000493636 527 ntTSL 38.85□□□□□ -0.992e-9■■■■■ 55.6
RBFOX2O43251 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.567e-7■■■■■ 55.6
RBFOX2O43251 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.597e-7■■■■■ 55.6
RBFOX2O43251 GSE1-201ENST00000253458 7495 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.627e-7■■■■■ 55.6
RBFOX2O43251 TRIM47-207ENST00000593089 392 ntTSL 215.34■□□□□ 0.052e-28■■■■■ 55.6
RBFOX2O43251 AGRN-203ENST00000461111 3385 ntTSL 1 (best)10.6□□□□□ -0.714e-9■■■■■ 55.6
RBFOX2O43251 ALOX12P2-210ENST00000574727 4326 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.096e-7■■■■■ 55.5
RBFOX2O43251 CDS2-202ENST00000450570 945 ntTSL 318.09■□□□□ 0.492e-12■■■■■ 55.2
RBFOX2O43251 CDS2-204ENST00000467923 783 ntTSL 317.84■□□□□ 0.452e-12■■■■■ 55.2
RBFOX2O43251 CDS2-205ENST00000468817 2706 ntTSL 210.98□□□□□ -0.652e-12■■■■■ 55.2
RBFOX2O43251 CDS2-206ENST00000486875 709 ntTSL 29.34□□□□□ -0.912e-12■■■■■ 55.2
RBFOX2O43251 AARS-203ENST00000565361 839 ntTSL 59.55□□□□□ -0.883e-18■■■■■ 54.8
RBFOX2O43251 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.582e-7■■■■■ 54.5
RBFOX2O43251 MPRIP-205ENST00000395811 10960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.782e-7■■■■■ 54.5
RBFOX2O43251 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.225e-17■■■■■ 54.4
RBFOX2O43251 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.035e-17■■■■■ 54.4
RBFOX2O43251 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.025e-17■■■■■ 54.4
RBFOX2O43251 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.195e-17■■■■■ 54.4
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