Protein–RNA interactions for Protein: O43174

CYP26A1, Cytochrome P450 26A1, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP26A1O43174 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CYP26A1O43174 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CYP26A1O43174 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CYP26A1O43174 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CYP26A1O43174 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CYP26A1O43174 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CYP26A1O43174 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CYP26A1O43174 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CYP26A1O43174 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CYP26A1O43174 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CYP26A1O43174 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CYP26A1O43174 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CYP26A1O43174 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CYP26A1O43174 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CYP26A1O43174 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CYP26A1O43174 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CYP26A1O43174 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CYP26A1O43174 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CYP26A1O43174 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CYP26A1O43174 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CYP26A1O43174 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CYP26A1O43174 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CYP26A1O43174 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CYP26A1O43174 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CYP26A1O43174 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CYP26A1O43174 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CYP26A1O43174 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CYP26A1O43174 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CYP26A1O43174 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CYP26A1O43174 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CYP26A1O43174 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CYP26A1O43174 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CYP26A1O43174 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CYP26A1O43174 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CYP26A1O43174 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CYP26A1O43174 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CYP26A1O43174 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CYP26A1O43174 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CYP26A1O43174 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CYP26A1O43174 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CYP26A1O43174 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CYP26A1O43174 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CYP26A1O43174 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CYP26A1O43174 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CYP26A1O43174 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CYP26A1O43174 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CYP26A1O43174 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CYP26A1O43174 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CYP26A1O43174 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CYP26A1O43174 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CYP26A1O43174 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CYP26A1O43174 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CYP26A1O43174 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CYP26A1O43174 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CYP26A1O43174 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CYP26A1O43174 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CYP26A1O43174 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CYP26A1O43174 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CYP26A1O43174 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CYP26A1O43174 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CYP26A1O43174 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CYP26A1O43174 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CYP26A1O43174 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CYP26A1O43174 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CYP26A1O43174 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CYP26A1O43174 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CYP26A1O43174 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CYP26A1O43174 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CYP26A1O43174 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CYP26A1O43174 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CYP26A1O43174 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CYP26A1O43174 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CYP26A1O43174 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CYP26A1O43174 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CYP26A1O43174 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CYP26A1O43174 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CYP26A1O43174 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CYP26A1O43174 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CYP26A1O43174 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CYP26A1O43174 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CYP26A1O43174 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CYP26A1O43174 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CYP26A1O43174 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CYP26A1O43174 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CYP26A1O43174 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CYP26A1O43174 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CYP26A1O43174 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CYP26A1O43174 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CYP26A1O43174 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CYP26A1O43174 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CYP26A1O43174 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CYP26A1O43174 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CYP26A1O43174 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CYP26A1O43174 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CYP26A1O43174 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CYP26A1O43174 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CYP26A1O43174 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CYP26A1O43174 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CYP26A1O43174 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CYP26A1O43174 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms