Protein–RNA interactions for Protein: E7EW58

LRRN3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN3E7EW58 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRN3E7EW58 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRN3E7EW58 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRN3E7EW58 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRN3E7EW58 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRN3E7EW58 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRN3E7EW58 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRN3E7EW58 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRN3E7EW58 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRN3E7EW58 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRN3E7EW58 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRN3E7EW58 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRN3E7EW58 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRN3E7EW58 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRN3E7EW58 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LRRN3E7EW58 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
LRRN3E7EW58 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRN3E7EW58 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRN3E7EW58 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRN3E7EW58 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRN3E7EW58 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRN3E7EW58 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRN3E7EW58 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRN3E7EW58 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRN3E7EW58 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRN3E7EW58 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRN3E7EW58 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRN3E7EW58 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRN3E7EW58 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRN3E7EW58 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRN3E7EW58 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRN3E7EW58 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRN3E7EW58 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRN3E7EW58 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRN3E7EW58 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRN3E7EW58 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRN3E7EW58 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRN3E7EW58 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRN3E7EW58 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRN3E7EW58 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRN3E7EW58 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRN3E7EW58 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRN3E7EW58 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRN3E7EW58 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRN3E7EW58 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRN3E7EW58 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LRRN3E7EW58 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LRRN3E7EW58 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRN3E7EW58 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRN3E7EW58 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRN3E7EW58 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRN3E7EW58 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRN3E7EW58 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRN3E7EW58 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRN3E7EW58 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRN3E7EW58 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRN3E7EW58 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRN3E7EW58 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRN3E7EW58 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRN3E7EW58 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRN3E7EW58 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRN3E7EW58 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRN3E7EW58 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRN3E7EW58 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRN3E7EW58 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRN3E7EW58 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRN3E7EW58 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRN3E7EW58 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRRN3E7EW58 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRRN3E7EW58 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRRN3E7EW58 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRRN3E7EW58 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRN3E7EW58 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRN3E7EW58 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRN3E7EW58 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRN3E7EW58 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRN3E7EW58 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRN3E7EW58 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRN3E7EW58 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRN3E7EW58 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRN3E7EW58 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRN3E7EW58 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRN3E7EW58 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRN3E7EW58 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRN3E7EW58 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRN3E7EW58 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRN3E7EW58 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRN3E7EW58 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRN3E7EW58 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRN3E7EW58 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRN3E7EW58 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRN3E7EW58 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRN3E7EW58 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRN3E7EW58 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRN3E7EW58 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRN3E7EW58 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRN3E7EW58 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRN3E7EW58 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRN3E7EW58 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRN3E7EW58 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms