Protein–RNA interactions for Protein: A6NF36

CCDC182, Coiled-coil domain-containing protein 182, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC182A6NF36 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC182A6NF36 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC182A6NF36 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC182A6NF36 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC182A6NF36 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC182A6NF36 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC182A6NF36 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC182A6NF36 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC182A6NF36 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC182A6NF36 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC182A6NF36 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC182A6NF36 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC182A6NF36 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC182A6NF36 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC182A6NF36 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC182A6NF36 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC182A6NF36 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC182A6NF36 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC182A6NF36 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC182A6NF36 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC182A6NF36 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC182A6NF36 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC182A6NF36 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC182A6NF36 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC182A6NF36 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC182A6NF36 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC182A6NF36 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC182A6NF36 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC182A6NF36 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC182A6NF36 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC182A6NF36 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC182A6NF36 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC182A6NF36 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC182A6NF36 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC182A6NF36 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC182A6NF36 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC182A6NF36 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC182A6NF36 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC182A6NF36 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC182A6NF36 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC182A6NF36 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC182A6NF36 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC182A6NF36 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC182A6NF36 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC182A6NF36 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC182A6NF36 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC182A6NF36 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC182A6NF36 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC182A6NF36 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC182A6NF36 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC182A6NF36 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC182A6NF36 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC182A6NF36 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC182A6NF36 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC182A6NF36 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC182A6NF36 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC182A6NF36 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC182A6NF36 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC182A6NF36 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC182A6NF36 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC182A6NF36 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC182A6NF36 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC182A6NF36 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC182A6NF36 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC182A6NF36 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC182A6NF36 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC182A6NF36 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC182A6NF36 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC182A6NF36 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC182A6NF36 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC182A6NF36 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC182A6NF36 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC182A6NF36 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC182A6NF36 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC182A6NF36 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC182A6NF36 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC182A6NF36 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC182A6NF36 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC182A6NF36 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC182A6NF36 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC182A6NF36 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC182A6NF36 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC182A6NF36 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC182A6NF36 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC182A6NF36 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC182A6NF36 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC182A6NF36 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC182A6NF36 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC182A6NF36 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC182A6NF36 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC182A6NF36 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC182A6NF36 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC182A6NF36 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC182A6NF36 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC182A6NF36 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC182A6NF36 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC182A6NF36 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC182A6NF36 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC182A6NF36 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC182A6NF36 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms