Protein–RNA interactions for Protein: A6NCL1

GMNC, Geminin coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMNCA6NCL1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
GMNCA6NCL1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GMNCA6NCL1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GMNCA6NCL1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GMNCA6NCL1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GMNCA6NCL1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GMNCA6NCL1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GMNCA6NCL1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GMNCA6NCL1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GMNCA6NCL1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GMNCA6NCL1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GMNCA6NCL1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GMNCA6NCL1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GMNCA6NCL1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GMNCA6NCL1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GMNCA6NCL1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GMNCA6NCL1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GMNCA6NCL1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GMNCA6NCL1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GMNCA6NCL1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GMNCA6NCL1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GMNCA6NCL1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GMNCA6NCL1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GMNCA6NCL1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
GMNCA6NCL1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GMNCA6NCL1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GMNCA6NCL1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GMNCA6NCL1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GMNCA6NCL1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GMNCA6NCL1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GMNCA6NCL1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GMNCA6NCL1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GMNCA6NCL1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GMNCA6NCL1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GMNCA6NCL1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GMNCA6NCL1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GMNCA6NCL1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GMNCA6NCL1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GMNCA6NCL1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GMNCA6NCL1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GMNCA6NCL1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GMNCA6NCL1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GMNCA6NCL1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GMNCA6NCL1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GMNCA6NCL1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GMNCA6NCL1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GMNCA6NCL1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GMNCA6NCL1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GMNCA6NCL1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GMNCA6NCL1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GMNCA6NCL1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GMNCA6NCL1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GMNCA6NCL1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GMNCA6NCL1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GMNCA6NCL1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GMNCA6NCL1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GMNCA6NCL1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GMNCA6NCL1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GMNCA6NCL1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GMNCA6NCL1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GMNCA6NCL1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GMNCA6NCL1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GMNCA6NCL1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GMNCA6NCL1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GMNCA6NCL1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GMNCA6NCL1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GMNCA6NCL1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GMNCA6NCL1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GMNCA6NCL1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GMNCA6NCL1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GMNCA6NCL1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GMNCA6NCL1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GMNCA6NCL1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GMNCA6NCL1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GMNCA6NCL1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GMNCA6NCL1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GMNCA6NCL1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GMNCA6NCL1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GMNCA6NCL1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GMNCA6NCL1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GMNCA6NCL1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GMNCA6NCL1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GMNCA6NCL1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GMNCA6NCL1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GMNCA6NCL1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GMNCA6NCL1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GMNCA6NCL1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GMNCA6NCL1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GMNCA6NCL1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
GMNCA6NCL1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GMNCA6NCL1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GMNCA6NCL1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GMNCA6NCL1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GMNCA6NCL1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
GMNCA6NCL1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GMNCA6NCL1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GMNCA6NCL1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GMNCA6NCL1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GMNCA6NCL1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GMNCA6NCL1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 156.2 ms