Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RR11

CENPVL1, Centromere protein V-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPVL1A0A0U1RR11 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPVL1A0A0U1RR11 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPVL1A0A0U1RR11 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPVL1A0A0U1RR11 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPVL1A0A0U1RR11 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPVL1A0A0U1RR11 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPVL1A0A0U1RR11 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPVL1A0A0U1RR11 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPVL1A0A0U1RR11 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CENPVL1A0A0U1RR11 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CENPVL1A0A0U1RR11 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPVL1A0A0U1RR11 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPVL1A0A0U1RR11 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPVL1A0A0U1RR11 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPVL1A0A0U1RR11 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPVL1A0A0U1RR11 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPVL1A0A0U1RR11 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPVL1A0A0U1RR11 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPVL1A0A0U1RR11 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPVL1A0A0U1RR11 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPVL1A0A0U1RR11 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPVL1A0A0U1RR11 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPVL1A0A0U1RR11 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPVL1A0A0U1RR11 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPVL1A0A0U1RR11 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPVL1A0A0U1RR11 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPVL1A0A0U1RR11 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPVL1A0A0U1RR11 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPVL1A0A0U1RR11 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPVL1A0A0U1RR11 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPVL1A0A0U1RR11 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPVL1A0A0U1RR11 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CENPVL1A0A0U1RR11 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CENPVL1A0A0U1RR11 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPVL1A0A0U1RR11 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPVL1A0A0U1RR11 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPVL1A0A0U1RR11 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPVL1A0A0U1RR11 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPVL1A0A0U1RR11 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPVL1A0A0U1RR11 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPVL1A0A0U1RR11 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPVL1A0A0U1RR11 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPVL1A0A0U1RR11 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPVL1A0A0U1RR11 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPVL1A0A0U1RR11 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPVL1A0A0U1RR11 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPVL1A0A0U1RR11 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CENPVL1A0A0U1RR11 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CENPVL1A0A0U1RR11 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CENPVL1A0A0U1RR11 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CENPVL1A0A0U1RR11 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CENPVL1A0A0U1RR11 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPVL1A0A0U1RR11 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPVL1A0A0U1RR11 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPVL1A0A0U1RR11 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPVL1A0A0U1RR11 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPVL1A0A0U1RR11 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPVL1A0A0U1RR11 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPVL1A0A0U1RR11 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPVL1A0A0U1RR11 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPVL1A0A0U1RR11 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPVL1A0A0U1RR11 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPVL1A0A0U1RR11 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPVL1A0A0U1RR11 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPVL1A0A0U1RR11 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPVL1A0A0U1RR11 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CENPVL1A0A0U1RR11 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CENPVL1A0A0U1RR11 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CENPVL1A0A0U1RR11 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CENPVL1A0A0U1RR11 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CENPVL1A0A0U1RR11 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CENPVL1A0A0U1RR11 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CENPVL1A0A0U1RR11 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CENPVL1A0A0U1RR11 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CENPVL1A0A0U1RR11 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CENPVL1A0A0U1RR11 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CENPVL1A0A0U1RR11 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CENPVL1A0A0U1RR11 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CENPVL1A0A0U1RR11 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CENPVL1A0A0U1RR11 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CENPVL1A0A0U1RR11 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CENPVL1A0A0U1RR11 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CENPVL1A0A0U1RR11 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CENPVL1A0A0U1RR11 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CENPVL1A0A0U1RR11 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CENPVL1A0A0U1RR11 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPVL1A0A0U1RR11 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPVL1A0A0U1RR11 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPVL1A0A0U1RR11 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPVL1A0A0U1RR11 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPVL1A0A0U1RR11 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPVL1A0A0U1RR11 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPVL1A0A0U1RR11 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPVL1A0A0U1RR11 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPVL1A0A0U1RR11 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPVL1A0A0U1RR11 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CENPVL1A0A0U1RR11 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPVL1A0A0U1RR11 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPVL1A0A0U1RR11 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPVL1A0A0U1RR11 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms