Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YYE9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
A0A0J9YYE9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
A0A0J9YYE9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
A0A0J9YYE9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
A0A0J9YYE9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
A0A0J9YYE9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
A0A0J9YYE9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
A0A0J9YYE9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
A0A0J9YYE9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
A0A0J9YYE9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
A0A0J9YYE9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
A0A0J9YYE9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
A0A0J9YYE9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
A0A0J9YYE9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
A0A0J9YYE9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
A0A0J9YYE9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
A0A0J9YYE9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
A0A0J9YYE9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
A0A0J9YYE9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
A0A0J9YYE9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
A0A0J9YYE9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
A0A0J9YYE9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
A0A0J9YYE9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
A0A0J9YYE9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
A0A0J9YYE9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
A0A0J9YYE9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
A0A0J9YYE9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
A0A0J9YYE9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
A0A0J9YYE9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
A0A0J9YYE9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
A0A0J9YYE9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
A0A0J9YYE9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
A0A0J9YYE9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
A0A0J9YYE9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
A0A0J9YYE9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
A0A0J9YYE9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
A0A0J9YYE9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
A0A0J9YYE9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
A0A0J9YYE9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
A0A0J9YYE9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
A0A0J9YYE9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
A0A0J9YYE9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
A0A0J9YYE9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
A0A0J9YYE9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
A0A0J9YYE9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
A0A0J9YYE9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
A0A0J9YYE9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
A0A0J9YYE9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
A0A0J9YYE9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
A0A0J9YYE9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
A0A0J9YYE9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
A0A0J9YYE9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
A0A0J9YYE9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
A0A0J9YYE9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
A0A0J9YYE9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
A0A0J9YYE9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
A0A0J9YYE9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
A0A0J9YYE9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
A0A0J9YYE9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
A0A0J9YYE9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
A0A0J9YYE9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
A0A0J9YYE9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
A0A0J9YYE9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
A0A0J9YYE9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
A0A0J9YYE9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
A0A0J9YYE9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
A0A0J9YYE9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
A0A0J9YYE9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
A0A0J9YYE9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
A0A0J9YYE9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
A0A0J9YYE9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
A0A0J9YYE9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
A0A0J9YYE9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
A0A0J9YYE9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
A0A0J9YYE9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
A0A0J9YYE9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
A0A0J9YYE9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
A0A0J9YYE9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
A0A0J9YYE9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
A0A0J9YYE9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
A0A0J9YYE9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
A0A0J9YYE9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
A0A0J9YYE9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
A0A0J9YYE9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
A0A0J9YYE9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
A0A0J9YYE9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
A0A0J9YYE9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
A0A0J9YYE9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
A0A0J9YYE9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
A0A0J9YYE9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
A0A0J9YYE9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
A0A0J9YYE9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
A0A0J9YYE9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
A0A0J9YYE9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
A0A0J9YYE9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
A0A0J9YYE9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
A0A0J9YYE9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
A0A0J9YYE9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
A0A0J9YYE9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
A0A0J9YYE9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms