Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1W7

NPIPA5, Nuclear pore complex-interacting protein family member A5, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA5A0A0B4J1W7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPIPA5A0A0B4J1W7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPIPA5A0A0B4J1W7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPIPA5A0A0B4J1W7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPIPA5A0A0B4J1W7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPIPA5A0A0B4J1W7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPIPA5A0A0B4J1W7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPIPA5A0A0B4J1W7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPIPA5A0A0B4J1W7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPIPA5A0A0B4J1W7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPIPA5A0A0B4J1W7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPIPA5A0A0B4J1W7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NPIPA5A0A0B4J1W7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NPIPA5A0A0B4J1W7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NPIPA5A0A0B4J1W7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPIPA5A0A0B4J1W7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPIPA5A0A0B4J1W7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPIPA5A0A0B4J1W7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPIPA5A0A0B4J1W7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPIPA5A0A0B4J1W7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPIPA5A0A0B4J1W7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPIPA5A0A0B4J1W7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPIPA5A0A0B4J1W7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPIPA5A0A0B4J1W7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPIPA5A0A0B4J1W7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NPIPA5A0A0B4J1W7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NPIPA5A0A0B4J1W7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPIPA5A0A0B4J1W7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPIPA5A0A0B4J1W7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPIPA5A0A0B4J1W7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPIPA5A0A0B4J1W7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NPIPA5A0A0B4J1W7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NPIPA5A0A0B4J1W7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NPIPA5A0A0B4J1W7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NPIPA5A0A0B4J1W7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NPIPA5A0A0B4J1W7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NPIPA5A0A0B4J1W7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NPIPA5A0A0B4J1W7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NPIPA5A0A0B4J1W7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NPIPA5A0A0B4J1W7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NPIPA5A0A0B4J1W7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPIPA5A0A0B4J1W7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPIPA5A0A0B4J1W7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPIPA5A0A0B4J1W7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NPIPA5A0A0B4J1W7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NPIPA5A0A0B4J1W7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NPIPA5A0A0B4J1W7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NPIPA5A0A0B4J1W7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPIPA5A0A0B4J1W7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPIPA5A0A0B4J1W7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPIPA5A0A0B4J1W7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NPIPA5A0A0B4J1W7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPIPA5A0A0B4J1W7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPIPA5A0A0B4J1W7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPIPA5A0A0B4J1W7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPIPA5A0A0B4J1W7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPIPA5A0A0B4J1W7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPIPA5A0A0B4J1W7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NPIPA5A0A0B4J1W7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NPIPA5A0A0B4J1W7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NPIPA5A0A0B4J1W7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NPIPA5A0A0B4J1W7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NPIPA5A0A0B4J1W7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPIPA5A0A0B4J1W7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPIPA5A0A0B4J1W7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NPIPA5A0A0B4J1W7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NPIPA5A0A0B4J1W7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NPIPA5A0A0B4J1W7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NPIPA5A0A0B4J1W7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NPIPA5A0A0B4J1W7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPIPA5A0A0B4J1W7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPIPA5A0A0B4J1W7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPIPA5A0A0B4J1W7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NPIPA5A0A0B4J1W7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPIPA5A0A0B4J1W7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPIPA5A0A0B4J1W7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPIPA5A0A0B4J1W7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NPIPA5A0A0B4J1W7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NPIPA5A0A0B4J1W7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NPIPA5A0A0B4J1W7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NPIPA5A0A0B4J1W7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NPIPA5A0A0B4J1W7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NPIPA5A0A0B4J1W7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NPIPA5A0A0B4J1W7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NPIPA5A0A0B4J1W7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NPIPA5A0A0B4J1W7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NPIPA5A0A0B4J1W7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NPIPA5A0A0B4J1W7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NPIPA5A0A0B4J1W7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NPIPA5A0A0B4J1W7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NPIPA5A0A0B4J1W7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NPIPA5A0A0B4J1W7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NPIPA5A0A0B4J1W7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPIPA5A0A0B4J1W7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NPIPA5A0A0B4J1W7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NPIPA5A0A0B4J1W7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NPIPA5A0A0B4J1W7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NPIPA5A0A0B4J1W7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NPIPA5A0A0B4J1W7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NPIPA5A0A0B4J1W7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms