Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PFDN4Q9NQP4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PFDN4Q9NQP4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PFDN4Q9NQP4 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PFDN4Q9NQP4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PFDN4Q9NQP4 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PFDN4Q9NQP4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PFDN4Q9NQP4 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PFDN4Q9NQP4 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PFDN4Q9NQP4 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PFDN4Q9NQP4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PFDN4Q9NQP4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PFDN4Q9NQP4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PFDN4Q9NQP4 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PFDN4Q9NQP4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PFDN4Q9NQP4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PFDN4Q9NQP4 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PFDN4Q9NQP4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PFDN4Q9NQP4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PFDN4Q9NQP4 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PFDN4Q9NQP4 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PFDN4Q9NQP4 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PFDN4Q9NQP4 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PFDN4Q9NQP4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PFDN4Q9NQP4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PFDN4Q9NQP4 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PFDN4Q9NQP4 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PFDN4Q9NQP4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PFDN4Q9NQP4 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PFDN4Q9NQP4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PFDN4Q9NQP4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PFDN4Q9NQP4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PFDN4Q9NQP4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PFDN4Q9NQP4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PFDN4Q9NQP4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PFDN4Q9NQP4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PFDN4Q9NQP4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PFDN4Q9NQP4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PFDN4Q9NQP4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PFDN4Q9NQP4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PFDN4Q9NQP4 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PFDN4Q9NQP4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PFDN4Q9NQP4 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PFDN4Q9NQP4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PFDN4Q9NQP4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PFDN4Q9NQP4 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PFDN4Q9NQP4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PFDN4Q9NQP4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PFDN4Q9NQP4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PFDN4Q9NQP4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PFDN4Q9NQP4 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PFDN4Q9NQP4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PFDN4Q9NQP4 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PFDN4Q9NQP4 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PFDN4Q9NQP4 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PFDN4Q9NQP4 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PFDN4Q9NQP4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PFDN4Q9NQP4 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PFDN4Q9NQP4 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PFDN4Q9NQP4 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PFDN4Q9NQP4 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PFDN4Q9NQP4 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PFDN4Q9NQP4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PFDN4Q9NQP4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PFDN4Q9NQP4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PFDN4Q9NQP4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PFDN4Q9NQP4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PFDN4Q9NQP4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PFDN4Q9NQP4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PFDN4Q9NQP4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PFDN4Q9NQP4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PFDN4Q9NQP4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PFDN4Q9NQP4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PFDN4Q9NQP4 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PFDN4Q9NQP4 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PFDN4Q9NQP4 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PFDN4Q9NQP4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PFDN4Q9NQP4 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PFDN4Q9NQP4 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PFDN4Q9NQP4 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PFDN4Q9NQP4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PFDN4Q9NQP4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PFDN4Q9NQP4 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PFDN4Q9NQP4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PFDN4Q9NQP4 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PFDN4Q9NQP4 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PFDN4Q9NQP4 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PFDN4Q9NQP4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PFDN4Q9NQP4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PFDN4Q9NQP4 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PFDN4Q9NQP4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms