Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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