Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW59

SPRYD4, SPRY domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRYD4Q8WW59 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPRYD4Q8WW59 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPRYD4Q8WW59 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPRYD4Q8WW59 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPRYD4Q8WW59 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPRYD4Q8WW59 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPRYD4Q8WW59 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPRYD4Q8WW59 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPRYD4Q8WW59 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SPRYD4Q8WW59 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPRYD4Q8WW59 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPRYD4Q8WW59 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPRYD4Q8WW59 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPRYD4Q8WW59 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPRYD4Q8WW59 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SPRYD4Q8WW59 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPRYD4Q8WW59 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPRYD4Q8WW59 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPRYD4Q8WW59 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPRYD4Q8WW59 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPRYD4Q8WW59 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPRYD4Q8WW59 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPRYD4Q8WW59 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPRYD4Q8WW59 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPRYD4Q8WW59 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPRYD4Q8WW59 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPRYD4Q8WW59 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPRYD4Q8WW59 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPRYD4Q8WW59 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPRYD4Q8WW59 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPRYD4Q8WW59 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPRYD4Q8WW59 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPRYD4Q8WW59 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPRYD4Q8WW59 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPRYD4Q8WW59 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPRYD4Q8WW59 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPRYD4Q8WW59 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPRYD4Q8WW59 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPRYD4Q8WW59 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPRYD4Q8WW59 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SPRYD4Q8WW59 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPRYD4Q8WW59 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPRYD4Q8WW59 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPRYD4Q8WW59 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPRYD4Q8WW59 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPRYD4Q8WW59 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPRYD4Q8WW59 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SPRYD4Q8WW59 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPRYD4Q8WW59 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPRYD4Q8WW59 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SPRYD4Q8WW59 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPRYD4Q8WW59 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPRYD4Q8WW59 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPRYD4Q8WW59 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPRYD4Q8WW59 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPRYD4Q8WW59 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPRYD4Q8WW59 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPRYD4Q8WW59 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPRYD4Q8WW59 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPRYD4Q8WW59 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPRYD4Q8WW59 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPRYD4Q8WW59 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPRYD4Q8WW59 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPRYD4Q8WW59 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPRYD4Q8WW59 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SPRYD4Q8WW59 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPRYD4Q8WW59 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPRYD4Q8WW59 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPRYD4Q8WW59 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPRYD4Q8WW59 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPRYD4Q8WW59 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPRYD4Q8WW59 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPRYD4Q8WW59 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPRYD4Q8WW59 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPRYD4Q8WW59 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPRYD4Q8WW59 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPRYD4Q8WW59 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPRYD4Q8WW59 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPRYD4Q8WW59 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SPRYD4Q8WW59 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPRYD4Q8WW59 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SPRYD4Q8WW59 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPRYD4Q8WW59 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPRYD4Q8WW59 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPRYD4Q8WW59 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPRYD4Q8WW59 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPRYD4Q8WW59 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPRYD4Q8WW59 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPRYD4Q8WW59 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPRYD4Q8WW59 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPRYD4Q8WW59 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPRYD4Q8WW59 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPRYD4Q8WW59 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SPRYD4Q8WW59 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPRYD4Q8WW59 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPRYD4Q8WW59 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPRYD4Q8WW59 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPRYD4Q8WW59 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPRYD4Q8WW59 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPRYD4Q8WW59 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms