Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT6

NLRX1, NLR family member X1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRX1Q86UT6 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRX1Q86UT6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRX1Q86UT6 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRX1Q86UT6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRX1Q86UT6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRX1Q86UT6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRX1Q86UT6 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRX1Q86UT6 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRX1Q86UT6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRX1Q86UT6 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRX1Q86UT6 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRX1Q86UT6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRX1Q86UT6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRX1Q86UT6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRX1Q86UT6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRX1Q86UT6 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRX1Q86UT6 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRX1Q86UT6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRX1Q86UT6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRX1Q86UT6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRX1Q86UT6 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRX1Q86UT6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRX1Q86UT6 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRX1Q86UT6 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRX1Q86UT6 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRX1Q86UT6 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRX1Q86UT6 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRX1Q86UT6 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRX1Q86UT6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRX1Q86UT6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRX1Q86UT6 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRX1Q86UT6 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRX1Q86UT6 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRX1Q86UT6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRX1Q86UT6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRX1Q86UT6 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRX1Q86UT6 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRX1Q86UT6 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRX1Q86UT6 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRX1Q86UT6 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRX1Q86UT6 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRX1Q86UT6 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRX1Q86UT6 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRX1Q86UT6 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRX1Q86UT6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRX1Q86UT6 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRX1Q86UT6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRX1Q86UT6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRX1Q86UT6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRX1Q86UT6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRX1Q86UT6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRX1Q86UT6 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRX1Q86UT6 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRX1Q86UT6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRX1Q86UT6 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRX1Q86UT6 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRX1Q86UT6 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRX1Q86UT6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRX1Q86UT6 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRX1Q86UT6 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRX1Q86UT6 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRX1Q86UT6 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRX1Q86UT6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRX1Q86UT6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRX1Q86UT6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRX1Q86UT6 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRX1Q86UT6 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRX1Q86UT6 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRX1Q86UT6 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRX1Q86UT6 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRX1Q86UT6 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRX1Q86UT6 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRX1Q86UT6 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRX1Q86UT6 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRX1Q86UT6 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRX1Q86UT6 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRX1Q86UT6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRX1Q86UT6 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NLRX1Q86UT6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NLRX1Q86UT6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NLRX1Q86UT6 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NLRX1Q86UT6 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NLRX1Q86UT6 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NLRX1Q86UT6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRX1Q86UT6 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRX1Q86UT6 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRX1Q86UT6 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRX1Q86UT6 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRX1Q86UT6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRX1Q86UT6 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRX1Q86UT6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRX1Q86UT6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRX1Q86UT6 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRX1Q86UT6 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRX1Q86UT6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRX1Q86UT6 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRX1Q86UT6 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRX1Q86UT6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRX1Q86UT6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRX1Q86UT6 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms