Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P8

SYT6, Synaptotagmin-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6Q5T7P8 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYT6Q5T7P8 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYT6Q5T7P8 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYT6Q5T7P8 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYT6Q5T7P8 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYT6Q5T7P8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYT6Q5T7P8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYT6Q5T7P8 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYT6Q5T7P8 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYT6Q5T7P8 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYT6Q5T7P8 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYT6Q5T7P8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYT6Q5T7P8 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYT6Q5T7P8 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYT6Q5T7P8 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYT6Q5T7P8 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYT6Q5T7P8 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYT6Q5T7P8 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYT6Q5T7P8 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYT6Q5T7P8 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYT6Q5T7P8 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYT6Q5T7P8 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYT6Q5T7P8 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYT6Q5T7P8 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYT6Q5T7P8 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYT6Q5T7P8 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYT6Q5T7P8 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYT6Q5T7P8 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYT6Q5T7P8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYT6Q5T7P8 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYT6Q5T7P8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SYT6Q5T7P8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYT6Q5T7P8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYT6Q5T7P8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYT6Q5T7P8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYT6Q5T7P8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYT6Q5T7P8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYT6Q5T7P8 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYT6Q5T7P8 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYT6Q5T7P8 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYT6Q5T7P8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYT6Q5T7P8 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYT6Q5T7P8 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYT6Q5T7P8 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYT6Q5T7P8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYT6Q5T7P8 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYT6Q5T7P8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYT6Q5T7P8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYT6Q5T7P8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYT6Q5T7P8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYT6Q5T7P8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYT6Q5T7P8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SYT6Q5T7P8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SYT6Q5T7P8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SYT6Q5T7P8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SYT6Q5T7P8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SYT6Q5T7P8 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYT6Q5T7P8 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYT6Q5T7P8 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYT6Q5T7P8 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYT6Q5T7P8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYT6Q5T7P8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYT6Q5T7P8 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYT6Q5T7P8 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYT6Q5T7P8 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYT6Q5T7P8 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYT6Q5T7P8 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYT6Q5T7P8 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYT6Q5T7P8 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYT6Q5T7P8 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYT6Q5T7P8 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYT6Q5T7P8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYT6Q5T7P8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYT6Q5T7P8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYT6Q5T7P8 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYT6Q5T7P8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SYT6Q5T7P8 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYT6Q5T7P8 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYT6Q5T7P8 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYT6Q5T7P8 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYT6Q5T7P8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYT6Q5T7P8 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYT6Q5T7P8 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYT6Q5T7P8 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYT6Q5T7P8 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SYT6Q5T7P8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SYT6Q5T7P8 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SYT6Q5T7P8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SYT6Q5T7P8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SYT6Q5T7P8 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SYT6Q5T7P8 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SYT6Q5T7P8 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SYT6Q5T7P8 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SYT6Q5T7P8 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SYT6Q5T7P8 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SYT6Q5T7P8 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SYT6Q5T7P8 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SYT6Q5T7P8 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms