Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C4orf17Q53FE4 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms