Protein–RNA interactions for Protein: Q2QD12

RPEL1, Ribulose-phosphate 3-epimerase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPEL1Q2QD12 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPEL1Q2QD12 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPEL1Q2QD12 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPEL1Q2QD12 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPEL1Q2QD12 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPEL1Q2QD12 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPEL1Q2QD12 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPEL1Q2QD12 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPEL1Q2QD12 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPEL1Q2QD12 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPEL1Q2QD12 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPEL1Q2QD12 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPEL1Q2QD12 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPEL1Q2QD12 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPEL1Q2QD12 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPEL1Q2QD12 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPEL1Q2QD12 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPEL1Q2QD12 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPEL1Q2QD12 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPEL1Q2QD12 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPEL1Q2QD12 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPEL1Q2QD12 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPEL1Q2QD12 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPEL1Q2QD12 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPEL1Q2QD12 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPEL1Q2QD12 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPEL1Q2QD12 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPEL1Q2QD12 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPEL1Q2QD12 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPEL1Q2QD12 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPEL1Q2QD12 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPEL1Q2QD12 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPEL1Q2QD12 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPEL1Q2QD12 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPEL1Q2QD12 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPEL1Q2QD12 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPEL1Q2QD12 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPEL1Q2QD12 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPEL1Q2QD12 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPEL1Q2QD12 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPEL1Q2QD12 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPEL1Q2QD12 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPEL1Q2QD12 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPEL1Q2QD12 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPEL1Q2QD12 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPEL1Q2QD12 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPEL1Q2QD12 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPEL1Q2QD12 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPEL1Q2QD12 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPEL1Q2QD12 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPEL1Q2QD12 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPEL1Q2QD12 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPEL1Q2QD12 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPEL1Q2QD12 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RPEL1Q2QD12 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RPEL1Q2QD12 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPEL1Q2QD12 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPEL1Q2QD12 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPEL1Q2QD12 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPEL1Q2QD12 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPEL1Q2QD12 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
RPEL1Q2QD12 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPEL1Q2QD12 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPEL1Q2QD12 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPEL1Q2QD12 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPEL1Q2QD12 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPEL1Q2QD12 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPEL1Q2QD12 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPEL1Q2QD12 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPEL1Q2QD12 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPEL1Q2QD12 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPEL1Q2QD12 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPEL1Q2QD12 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPEL1Q2QD12 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPEL1Q2QD12 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPEL1Q2QD12 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPEL1Q2QD12 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPEL1Q2QD12 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPEL1Q2QD12 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPEL1Q2QD12 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RPEL1Q2QD12 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPEL1Q2QD12 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPEL1Q2QD12 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPEL1Q2QD12 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPEL1Q2QD12 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPEL1Q2QD12 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPEL1Q2QD12 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPEL1Q2QD12 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPEL1Q2QD12 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPEL1Q2QD12 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPEL1Q2QD12 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPEL1Q2QD12 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPEL1Q2QD12 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPEL1Q2QD12 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPEL1Q2QD12 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPEL1Q2QD12 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPEL1Q2QD12 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPEL1Q2QD12 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPEL1Q2QD12 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPEL1Q2QD12 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms