Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.945e-7■■□□□ 11.8
PUM1Q14671 CHD9-209ENST00000564255 2896 ntTSL 52.77□□□□□ -1.975e-7■■□□□ 11.8
PUM1Q14671 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.975e-7■■□□□ 11.8
PUM1Q14671 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.995e-7■■□□□ 11.8
PUM1Q14671 SFPQ-206ENST00000470472 874 ntTSL 54.08□□□□□ -1.761e-18■■□□□ 11.8
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PUM1Q14671 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.025e-7■■□□□ 11.8
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PUM1Q14671 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.342e-7■■□□□ 11.8
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PUM1Q14671 TAF1-203ENST00000373790 7629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.149e-7■■□□□ 11.8
PUM1Q14671 TAF1-204ENST00000423759 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.169e-7■■□□□ 11.8
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PUM1Q14671 CHD4-205ENST00000536301 107 ntTSL 36.04□□□□□ -1.441e-6■■□□□ 11.8
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PUM1Q14671 HSPA4-204ENST00000615899 2204 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.431e-6■■□□□ 11.8
PUM1Q14671 HSPA4-201ENST00000304858 4825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.561e-6■■□□□ 11.8
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PUM1Q14671 SF3A3-208ENST00000489537 891 ntTSL 45.91□□□□□ -1.461e-6■■□□□ 11.7
PUM1Q14671 EIF4A2-201ENST00000323963 1919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.92e-8■■□□□ 11.7
PUM1Q14671 EIF4A2-203ENST00000426808 1751 ntTSL 1 (best)7.65□□□□□ -1.182e-8■■□□□ 11.7
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PUM1Q14671 EIF4A2-204ENST00000429589 1005 ntTSL 57.15□□□□□ -1.262e-8■■□□□ 11.7
PUM1Q14671 EIF4A2-205ENST00000440191 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.312e-8■■□□□ 11.7
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PUM1Q14671 EIF4A2-219ENST00000485101 5327 ntTSL 54.06□□□□□ -1.762e-8■■□□□ 11.7
PUM1Q14671 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.475e-9■■□□□ 11.7
PUM1Q14671 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.894e-6■■□□□ 11.7
PUM1Q14671 DPP7-202ENST00000460830 639 ntTSL 220.56■□□□□ 0.885e-9■■□□□ 11.7
PUM1Q14671 PIP4K2B-202ENST00000617499 547 ntTSL 419.95■□□□□ 0.785e-9■■□□□ 11.7
PUM1Q14671 RNF40-203ENST00000493683 5371 ntTSL 219.65■□□□□ 0.744e-6■■□□□ 11.7
PUM1Q14671 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.075e-9■■□□□ 11.7
PUM1Q14671 DPP7-203ENST00000463619 775 ntTSL 314.98□□□□□ -0.015e-9■■□□□ 11.7
PUM1Q14671 EIF3K-205ENST00000586932 667 ntTSL 213.25□□□□□ -0.295e-9■■□□□ 11.7
PUM1Q14671 RNF40-211ENST00000567365 597 ntTSL 312.51□□□□□ -0.414e-6■■□□□ 11.7
PUM1Q14671 PIP4K2B-203ENST00000617781 927 ntTSL 212.19□□□□□ -0.465e-9■■□□□ 11.7
PUM1Q14671 EIF3K-204ENST00000586513 493 ntTSL 511.57□□□□□ -0.565e-9■■□□□ 11.7
PUM1Q14671 EIF3K-207ENST00000588422 507 ntTSL 211.36□□□□□ -0.595e-9■■□□□ 11.7
PUM1Q14671 INTS11-212ENST00000462432 2863 ntTSL 1 (best)11.21□□□□□ -0.621e-9■■□□□ 11.7
PUM1Q14671 EIF3K-212ENST00000593062 704 ntTSL 210.28□□□□□ -0.765e-9■■□□□ 11.7
PUM1Q14671 RNF40-204ENST00000563683 4063 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.854e-6■■□□□ 11.7
PUM1Q14671 EIF3K-206ENST00000588299 524 ntTSL 29.62□□□□□ -0.875e-9■■□□□ 11.7
PUM1Q14671 RNF40-202ENST00000357890 3917 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.914e-6■■□□□ 11.7
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PUM1Q14671 HNRNPAB-203ENST00000504796 578 ntTSL 28.83□□□□□ -11e-8■■□□□ 11.7
PUM1Q14671 RPS25-204ENST00000527853 1462 ntTSL 218.69■□□□□ 0.581e-29■■□□□ 11.7
PUM1Q14671 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -01e-29■■□□□ 11.7
PUM1Q14671 RPS25-203ENST00000527791 711 ntTSL 212.74□□□□□ -0.371e-29■■□□□ 11.7
PUM1Q14671 RPS25-206ENST00000532567 508 ntTSL 26.34□□□□□ -1.391e-29■■□□□ 11.7
PUM1Q14671 GTPBP4-203ENST00000483839 596 ntTSL 210.18□□□□□ -0.782e-7■■□□□ 11.7
PUM1Q14671 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.262e-8■■□□□ 11.7
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