Protein–RNA interactions for Protein: P68036

UBE2L3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 L3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2L3P68036 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2L3P68036 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2L3P68036 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2L3P68036 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2L3P68036 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2L3P68036 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2L3P68036 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2L3P68036 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2L3P68036 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2L3P68036 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2L3P68036 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2L3P68036 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2L3P68036 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2L3P68036 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2L3P68036 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2L3P68036 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2L3P68036 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms