Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms