Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms