Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CREB1P16220 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CREB1P16220 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CREB1P16220 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CREB1P16220 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CREB1P16220 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CREB1P16220 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CREB1P16220 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CREB1P16220 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CREB1P16220 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CREB1P16220 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CREB1P16220 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CREB1P16220 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CREB1P16220 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CREB1P16220 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CREB1P16220 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CREB1P16220 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CREB1P16220 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CREB1P16220 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CREB1P16220 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CREB1P16220 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CREB1P16220 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CREB1P16220 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CREB1P16220 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CREB1P16220 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CREB1P16220 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CREB1P16220 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CREB1P16220 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CREB1P16220 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CREB1P16220 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CREB1P16220 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CREB1P16220 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CREB1P16220 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CREB1P16220 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CREB1P16220 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CREB1P16220 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CREB1P16220 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREB1P16220 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREB1P16220 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREB1P16220 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREB1P16220 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREB1P16220 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CREB1P16220 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREB1P16220 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREB1P16220 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREB1P16220 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREB1P16220 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREB1P16220 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREB1P16220 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREB1P16220 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB1P16220 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB1P16220 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB1P16220 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB1P16220 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB1P16220 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB1P16220 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB1P16220 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB1P16220 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB1P16220 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB1P16220 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB1P16220 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB1P16220 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB1P16220 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB1P16220 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB1P16220 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB1P16220 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB1P16220 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB1P16220 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB1P16220 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CREB1P16220 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CREB1P16220 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CREB1P16220 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CREB1P16220 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CREB1P16220 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CREB1P16220 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CREB1P16220 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CREB1P16220 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CREB1P16220 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CREB1P16220 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CREB1P16220 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CREB1P16220 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CREB1P16220 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CREB1P16220 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CREB1P16220 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CREB1P16220 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CREB1P16220 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CREB1P16220 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CREB1P16220 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CREB1P16220 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CREB1P16220 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CREB1P16220 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CREB1P16220 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CREB1P16220 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CREB1P16220 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CREB1P16220 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CREB1P16220 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CREB1P16220 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CREB1P16220 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CREB1P16220 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CREB1P16220 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms